More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6561 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 397 aa  771    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  84.05 
 
 		 393 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  75.07 
 
 		 402 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  75.07 
 
 		 401 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  74.58 
 
 		 401 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  70.16 
 
 		 421 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  50.14 
 
 		 411 aa  338  7e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  52.07 
 
 		 413 aa  333  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  48.68 
 
 		 404 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  48.68 
 
 		 406 aa  329  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  57.73 
 
 		 405 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  54.21 
 
 		 411 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  50.39 
 
 		 402 aa  319  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  52.29 
 
 		 456 aa  315  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  53.61 
 
 		 408 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  53.61 
 
 		 419 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  53.19 
 
 		 422 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  42.61 
 
 		 368 aa  281  2e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  45.89 
 
 		 391 aa  279  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  46.87 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  43.18 
 
 		 396 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  44 
 
 		 375 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  44.38 
 
 		 372 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  41.71 
 
 		 413 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  40.77 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  41.07 
 
 		 351 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 352 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  41.67 
 
 		 373 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  44.72 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  40.67 
 
 		 390 aa  250  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 372 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  40.18 
 
 		 351 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  39.58 
 
 		 351 aa  249  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  43.35 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  38.75 
 
 		 352 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  41.13 
 
 		 393 aa  245  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  43.83 
 
 		 350 aa  243  5e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  41.42 
 
 		 373 aa  239  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  42.41 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  42.41 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  42.41 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  40.52 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  43.34 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  41.87 
 
 		 385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  43.31 
 
 		 373 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  36.95 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  41.8 
 
 		 404 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  40.35 
 
 		 394 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 354 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  39.01 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  39.6 
 
 		 380 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  41.12 
 
 		 383 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  38.29 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  44.89 
 
 		 414 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  37.97 
 
 		 363 aa  223  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  40.7 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  38.06 
 
 		 375 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  40.18 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 		 374 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  41.29 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  41.76 
 
 		 381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  38.94 
 
 		 381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  41.07 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  42.7 
 
 		 374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  42.7 
 
 		 374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  41.29 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  42.7 
 
 		 374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  36.42 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  42.9 
 
 		 372 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.82 
 
 		 365 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  39.6 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  36.21 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  36.21 
 
 		 355 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  36.73 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  41.81 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  41.44 
 
 		 425 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  39.05 
 
 		 363 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  38.96 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  39.37 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  39.05 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  39.37 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  44.69 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  35.54 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  39.05 
 
 		 364 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  39.05 
 
 		 364 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  36.91 
 
 		 349 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48280  putative multidrug resistance efflux pump  43.29 
 
 		 383 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0160418  normal  0.0591644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  42.77 
 
 		 346 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  40.11 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  40.07 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  41.89 
 
 		 397 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  35.53 
 
 		 366 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>