More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1715 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  100 
 
 		 383 aa  761    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  51.06 
 
 		 404 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  52.96 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  47.54 
 
 		 372 aa  291  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  47.67 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  48.6 
 
 		 373 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  49.17 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  47.89 
 
 		 400 aa  279  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  47.89 
 
 		 373 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  47.62 
 
 		 374 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  47.62 
 
 		 374 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  47.62 
 
 		 374 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  42.08 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  42.5 
 
 		 413 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  47.31 
 
 		 388 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  42.68 
 
 		 390 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  43.84 
 
 		 396 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  42.72 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  39.84 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  40.92 
 
 		 350 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  42.81 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  42.81 
 
 		 351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  42.81 
 
 		 351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  41.74 
 
 		 393 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  42.68 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  42.07 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  42.07 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  42.07 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  41.77 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  41.21 
 
 		 366 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  39.77 
 
 		 394 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  42.77 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  41.5 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  41.54 
 
 		 348 aa  225  9e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  41.84 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  41.16 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  41.4 
 
 		 394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  40.84 
 
 		 414 aa  222  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  36.93 
 
 		 411 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  40.46 
 
 		 375 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  38.37 
 
 		 380 aa  220  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  39.74 
 
 		 380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  39.94 
 
 		 363 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  42.51 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  43.02 
 
 		 405 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  42.32 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  42.41 
 
 		 364 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  41.12 
 
 		 358 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  42.63 
 
 		 364 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  41.53 
 
 		 372 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  42.14 
 
 		 378 aa  216  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  42.5 
 
 		 363 aa  216  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  40.81 
 
 		 385 aa  215  9e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  42.41 
 
 		 364 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  42.41 
 
 		 364 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  42.01 
 
 		 363 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  41.3 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  37.35 
 
 		 413 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  38.34 
 
 		 374 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  40.84 
 
 		 344 aa  211  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  40.97 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  39.2 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  39.22 
 
 		 421 aa  210  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  38.71 
 
 		 404 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  39.84 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  40.96 
 
 		 374 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  40.05 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  37.28 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  39.83 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  40.68 
 
 		 374 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  40.68 
 
 		 374 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  39.42 
 
 		 419 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  37.43 
 
 		 341 aa  206  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  38.94 
 
 		 456 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  40.78 
 
 		 352 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  37.43 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  40.67 
 
 		 363 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  39.02 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.65 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  39.27 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  42.91 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  36.53 
 
 		 349 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  35.76 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  36.36 
 
 		 372 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  40.64 
 
 		 353 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  34.72 
 
 		 366 aa  199  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  39.6 
 
 		 408 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  36.88 
 
 		 342 aa  199  9e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  38.85 
 
 		 356 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  37.67 
 
 		 401 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  39.29 
 
 		 354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  36.53 
 
 		 387 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  39.1 
 
 		 400 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  36.13 
 
 		 344 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  38.18 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  36.19 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  35.83 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 		 360 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  35.38 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>