More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2928 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 372 aa  727    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  86.1 
 
 		 374 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  85.83 
 
 		 374 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  85.83 
 
 		 374 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  51.53 
 
 		 393 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  46.94 
 
 		 413 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  51.96 
 
 		 381 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  46.91 
 
 		 380 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  52.23 
 
 		 425 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  46.61 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  48.05 
 
 		 385 aa  271  9e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  45.18 
 
 		 375 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  48.73 
 
 		 372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  46.91 
 
 		 396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  46.43 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  45.97 
 
 		 414 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  44.26 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  46.98 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  47.32 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  42.19 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  47.95 
 
 		 372 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  47.9 
 
 		 378 aa  258  8e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  50.15 
 
 		 374 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  50.15 
 
 		 374 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  50.15 
 
 		 374 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  48.66 
 
 		 390 aa  255  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  45.94 
 
 		 394 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  43.35 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  48.18 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  43.56 
 
 		 375 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  48.18 
 
 		 363 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  47.58 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48280  putative multidrug resistance efflux pump  54.49 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0160418  normal  0.0591644 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  45.6 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  48.18 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  47.11 
 
 		 364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  47.7 
 
 		 373 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  47.27 
 
 		 364 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  47.27 
 
 		 364 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  44.13 
 
 		 374 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  46.69 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  42.29 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  42.12 
 
 		 354 aa  242  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  40.72 
 
 		 404 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  42.43 
 
 		 390 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  40.9 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  40.41 
 
 		 351 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  47.38 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  42.32 
 
 		 344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  45.19 
 
 		 393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 351 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  43.23 
 
 		 344 aa  235  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  46 
 
 		 377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  41 
 
 		 355 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 351 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  41.42 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  46.46 
 
 		 354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  46.47 
 
 		 402 aa  233  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  41.69 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  40.92 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  39.72 
 
 		 363 aa  229  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  40.87 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  45.07 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  44.01 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  42.99 
 
 		 342 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  46.29 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  40.35 
 
 		 351 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  41.79 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  41.37 
 
 		 352 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  44.81 
 
 		 397 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  45.13 
 
 		 353 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  39.83 
 
 		 351 aa  223  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  40.95 
 
 		 456 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  43.57 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  43.24 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  40.73 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  40.23 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  38.62 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  40.47 
 
 		 413 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  47.43 
 
 		 371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  42.09 
 
 		 365 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  43.6 
 
 		 401 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  38.32 
 
 		 411 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  37.88 
 
 		 349 aa  219  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  38.29 
 
 		 349 aa  219  7.999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  45.76 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  41 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  42.99 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  45.76 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  38.94 
 
 		 350 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  34.4 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  42.74 
 
 		 360 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  40.27 
 
 		 408 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  43.18 
 
 		 405 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  40.56 
 
 		 400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  45.76 
 
 		 353 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>