More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1624 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 377 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  70.2 
 
 		 371 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  48.93 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  48.39 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  50 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  41.67 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  44.1 
 
 		 413 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  50.32 
 
 		 352 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  43.01 
 
 		 383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  41.19 
 
 		 351 aa  253  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  41.19 
 
 		 351 aa  252  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  43.79 
 
 		 414 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  40.94 
 
 		 352 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  40.94 
 
 		 352 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  40.94 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  47.94 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  41 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  40.94 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  47.23 
 
 		 353 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  47.23 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  45.48 
 
 		 378 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  47.76 
 
 		 353 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  48.91 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  43.34 
 
 		 375 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  40.88 
 
 		 380 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  43.67 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  46.13 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  43.19 
 
 		 358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  45.29 
 
 		 393 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  44.59 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  42.82 
 
 		 344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  45.71 
 
 		 372 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  44.59 
 
 		 363 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  44.59 
 
 		 363 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  44.27 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  37.87 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  43.17 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  47.89 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  47.89 
 
 		 374 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  47.89 
 
 		 374 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  43.45 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  43.95 
 
 		 364 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  42.53 
 
 		 358 aa  236  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  43.95 
 
 		 364 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  43.95 
 
 		 364 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  38.74 
 
 		 352 aa  236  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  46.27 
 
 		 396 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  40.96 
 
 		 352 aa  235  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  44.76 
 
 		 363 aa  235  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  47.87 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  39.34 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  41.07 
 
 		 350 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  44.07 
 
 		 373 aa  229  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  41.67 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  42.17 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  38.99 
 
 		 404 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  36.94 
 
 		 351 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  42.9 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  41.64 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  39.05 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  41.4 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 358 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  42.16 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  38.89 
 
 		 358 aa  223  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  41.96 
 
 		 349 aa  223  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  41.6 
 
 		 375 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  42.22 
 
 		 387 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  43.7 
 
 		 394 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  42.51 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  44.21 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48280  putative multidrug resistance efflux pump  46.6 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0160418  normal  0.0591644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  40.54 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  43.54 
 
 		 358 aa  220  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  43.7 
 
 		 358 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  46.29 
 
 		 381 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  41.83 
 
 		 411 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  46.44 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  46.03 
 
 		 371 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  40.82 
 
 		 358 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  40.6 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  41.08 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  43.7 
 
 		 358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  41.88 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 351 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  45.75 
 
 		 425 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  38.17 
 
 		 349 aa  215  9e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  38.17 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.02 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.5 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  43.45 
 
 		 358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  37.06 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  39.89 
 
 		 372 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  38.06 
 
 		 467 aa  212  7.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  41.92 
 
 		 354 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  41.25 
 
 		 386 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  38.62 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  40.34 
 
 		 301 aa  209  9e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.51 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 360 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>