More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1696 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  97.49 
 
 		 358 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 358 aa  711    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  72.75 
 
 		 358 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  77.09 
 
 		 358 aa  494  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  56.82 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  52.1 
 
 		 358 aa  327  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  57.05 
 
 		 354 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  52.76 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  51.47 
 
 		 349 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  52.94 
 
 		 344 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  47.4 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  51.1 
 
 		 356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 413 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  50.8 
 
 		 383 aa  298  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  52.76 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  52.76 
 
 		 367 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  48.84 
 
 		 342 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  52.45 
 
 		 367 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  51.51 
 
 		 360 aa  288  7e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  51.44 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  52.65 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  52.72 
 
 		 396 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  51.84 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  46.83 
 
 		 380 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  44.38 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  48.08 
 
 		 394 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  46.35 
 
 		 383 aa  256  6e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  46.27 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  49.19 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  46.61 
 
 		 375 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  43.71 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  43.92 
 
 		 363 aa  242  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  44.82 
 
 		 373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  43.95 
 
 		 414 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  44.07 
 
 		 375 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  42.65 
 
 		 393 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  44.11 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  46.96 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  45.86 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  45.13 
 
 		 363 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  46.43 
 
 		 363 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  44.98 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  44.81 
 
 		 363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  44.48 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  44.48 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  44.48 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  42.37 
 
 		 383 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  43.23 
 
 		 344 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  43.18 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  41.52 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  39.65 
 
 		 344 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  42.81 
 
 		 390 aa  222  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  43.98 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  39.36 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  42.81 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  40.58 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  40.78 
 
 		 350 aa  215  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  38.86 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  40.95 
 
 		 404 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  42.52 
 
 		 365 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  43.11 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  42.99 
 
 		 381 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  41.11 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  37.84 
 
 		 393 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  41.46 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  36.45 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  40.17 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  40.62 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  36.47 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  41.4 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  36.15 
 
 		 422 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  40.82 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  38.69 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  36.18 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  42.09 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  40 
 
 		 348 aa  202  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  42.49 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  42.49 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  42.49 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  41.72 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  39.08 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  36.47 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  40.86 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  37.09 
 
 		 386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  36.61 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  40.86 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  40.86 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48280  putative multidrug resistance efflux pump  42.81 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0160418  normal  0.0591644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  38.58 
 
 		 344 aa  196  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.77 
 
 		 352 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.77 
 
 		 352 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  41.53 
 
 		 397 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  35.76 
 
 		 349 aa  196  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  34.04 
 
 		 364 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  40.24 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  36.84 
 
 		 349 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 352 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>