More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4283 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 365 aa  721    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  55.22 
 
 		 344 aa  345  7e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  43.94 
 
 		 366 aa  269  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  46.73 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  44.57 
 
 		 413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  48.69 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  42.73 
 
 		 364 aa  258  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  48.04 
 
 		 363 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  43.07 
 
 		 351 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  48.04 
 
 		 363 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  43.07 
 
 		 351 aa  255  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  44.06 
 
 		 375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  42.56 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  42.77 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 		 351 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 352 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  45.12 
 
 		 380 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  47.39 
 
 		 363 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  45.08 
 
 		 385 aa  248  8e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  45.27 
 
 		 374 aa  248  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  47.06 
 
 		 364 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  47.06 
 
 		 364 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  47.06 
 
 		 364 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  40.88 
 
 		 355 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  42.94 
 
 		 393 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  46.41 
 
 		 364 aa  245  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  42.04 
 
 		 348 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  42.31 
 
 		 383 aa  242  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  44.31 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  44.16 
 
 		 390 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  44.54 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  42.99 
 
 		 373 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  42.69 
 
 		 372 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  41.74 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  40.41 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  43.67 
 
 		 358 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  42.24 
 
 		 373 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  43.67 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  42.65 
 
 		 372 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  39.53 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 404 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  42.65 
 
 		 400 aa  226  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  44.2 
 
 		 374 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  44.2 
 
 		 374 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  44.2 
 
 		 374 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  45.31 
 
 		 373 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  45.14 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  44.3 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  44.92 
 
 		 352 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  39.47 
 
 		 402 aa  222  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  41.37 
 
 		 342 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  41.25 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  43.09 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  35.88 
 
 		 368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  42.15 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  42.86 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  43.55 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  41.24 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  38.78 
 
 		 351 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  39.83 
 
 		 401 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  42.18 
 
 		 371 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  41.47 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  39.83 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  38.26 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  38.26 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  42.27 
 
 		 393 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  37.1 
 
 		 349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  37.1 
 
 		 349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  38.3 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  38.28 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  41.85 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  41.38 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  41.41 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  43.27 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  42.34 
 
 		 374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  39.2 
 
 		 421 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  42.34 
 
 		 374 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  42.34 
 
 		 374 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  41.9 
 
 		 404 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  44.01 
 
 		 419 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  41.25 
 
 		 341 aa  212  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 358 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  33.81 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  39.42 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  40.47 
 
 		 394 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  39.37 
 
 		 413 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  36.2 
 
 		 344 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  36.2 
 
 		 355 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  42.25 
 
 		 456 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  40.82 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  41.67 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  39.65 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  42.49 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  39.82 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>