More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1157 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  100 
 
 		 344 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  94.77 
 
 		 344 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  60.29 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  57.31 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  52.35 
 
 		 358 aa  309  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  52.94 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  51.15 
 
 		 354 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  50.65 
 
 		 352 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  49.69 
 
 		 358 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  49.84 
 
 		 358 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  49.85 
 
 		 360 aa  285  9e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  49.68 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  50.81 
 
 		 356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  46.02 
 
 		 358 aa  282  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  50.65 
 
 		 385 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  46.89 
 
 		 342 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  46.41 
 
 		 358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  51.47 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  51.48 
 
 		 394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  45.33 
 
 		 358 aa  265  5.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  48.09 
 
 		 353 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  45.37 
 
 		 413 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  51.97 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  47.08 
 
 		 367 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  46.94 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  43.18 
 
 		 414 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  42.51 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  47.66 
 
 		 353 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  41.05 
 
 		 380 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  48.2 
 
 		 396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  43.51 
 
 		 390 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  40.42 
 
 		 366 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  45.87 
 
 		 392 aa  232  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  42.35 
 
 		 363 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  42.35 
 
 		 364 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  42.35 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  42.35 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  42.35 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  42.35 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  42.67 
 
 		 363 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  41.72 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  39.82 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  44.77 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  42.35 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  43.51 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  40.84 
 
 		 372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  40.86 
 
 		 390 aa  216  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  44.21 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  40.84 
 
 		 411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  37.8 
 
 		 351 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  44.05 
 
 		 371 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  40 
 
 		 393 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  37.35 
 
 		 352 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  41.97 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  36.5 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  42.19 
 
 		 456 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  36.36 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 351 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  39.62 
 
 		 351 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  39.47 
 
 		 390 aa  206  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  37.05 
 
 		 355 aa  206  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  42.81 
 
 		 422 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  39.31 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  36.31 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  36.31 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  40.24 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  39.74 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  41.31 
 
 		 360 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 352 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  41.48 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  40.19 
 
 		 419 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  35.78 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 352 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 352 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  39.02 
 
 		 350 aa  202  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  39.34 
 
 		 383 aa  202  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  40.53 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  40.58 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  41.2 
 
 		 400 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 422 aa  199  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  39.68 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  37.67 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  38.11 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  40.51 
 
 		 397 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  40.52 
 
 		 408 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  40.84 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  42.95 
 
 		 372 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  40.99 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  38.07 
 
 		 354 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  41.78 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  37.33 
 
 		 406 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  39.7 
 
 		 385 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  35.14 
 
 		 366 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  38.81 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  38.12 
 
 		 373 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  39.29 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  33.64 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>