More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2921 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
344 aa  673    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  94.77 
 
 
344 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  59.59 
 
 
349 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  58.48 
 
 
363 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  52.06 
 
 
358 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  52.65 
 
 
358 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  50.65 
 
 
352 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  50.16 
 
 
354 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 
358 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  49.84 
 
 
358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  49.68 
 
 
383 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  47.45 
 
 
358 aa  282  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  50.15 
 
 
360 aa  282  8.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  51.15 
 
 
385 aa  281  9e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  47.21 
 
 
342 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  50.49 
 
 
356 aa  275  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  45.51 
 
 
358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  48.66 
 
 
394 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  52.3 
 
 
394 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  50.49 
 
 
354 aa  262  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  48.39 
 
 
353 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  44.82 
 
 
358 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  46.56 
 
 
413 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  43.43 
 
 
380 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  47.37 
 
 
367 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  47.23 
 
 
367 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  44.67 
 
 
414 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  47.95 
 
 
353 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  47.21 
 
 
396 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  41.05 
 
 
380 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  41.32 
 
 
366 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  42.39 
 
 
375 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  43.41 
 
 
390 aa  232  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  40.72 
 
 
375 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  46.2 
 
 
392 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  43 
 
 
363 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  43.33 
 
 
363 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  43 
 
 
364 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  43 
 
 
364 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  43 
 
 
364 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  43 
 
 
363 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  45.1 
 
 
383 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  43.19 
 
 
364 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  41.87 
 
 
372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  43.83 
 
 
346 aa  222  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  43.38 
 
 
378 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 
374 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  41.2 
 
 
390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  42.19 
 
 
456 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  40.72 
 
 
411 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  42.62 
 
 
373 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  40.12 
 
 
393 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  38.12 
 
 
352 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  40.87 
 
 
390 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  36.95 
 
 
344 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  36.95 
 
 
355 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 
351 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  42.09 
 
 
422 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  42.4 
 
 
377 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  38.05 
 
 
344 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 
364 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  41.02 
 
 
400 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  43.03 
 
 
360 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  36.45 
 
 
406 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  37.23 
 
 
404 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  42.81 
 
 
400 aa  202  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  41.86 
 
 
371 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  39.56 
 
 
368 aa  202  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  42.41 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  38.72 
 
 
422 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  36.76 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  40.06 
 
 
419 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  38.36 
 
 
387 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  39.02 
 
 
350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  38.05 
 
 
351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  38.36 
 
 
387 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  37.09 
 
 
351 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  41.78 
 
 
383 aa  199  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  41.3 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  36.8 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  42.99 
 
 
372 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  41.25 
 
 
371 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 
352 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 
352 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  39.02 
 
 
372 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  39.74 
 
 
344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  38.82 
 
 
373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 
352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  41.4 
 
 
397 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 
352 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  43.09 
 
 
381 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  40.72 
 
 
408 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  42.32 
 
 
404 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  40.53 
 
 
349 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  38.05 
 
 
380 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  41.19 
 
 
425 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  40.19 
 
 
402 aa  192  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  37.96 
 
 
354 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  40.95 
 
 
374 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  40.95 
 
 
374 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>