More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5589 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  100 
 
 		 346 aa  689    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  64.24 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  57.45 
 
 		 422 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  62.35 
 
 		 325 aa  351  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  50.16 
 
 		 385 aa  272  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  47.13 
 
 		 383 aa  272  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  48.62 
 
 		 413 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  44.03 
 
 		 414 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  42.56 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  46.37 
 
 		 378 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  45.92 
 
 		 394 aa  245  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  45.78 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  45.02 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  44.04 
 
 		 380 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  47.62 
 
 		 396 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  42.63 
 
 		 404 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  42.49 
 
 		 342 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  42.6 
 
 		 344 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  42.57 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  42.95 
 
 		 390 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  43.44 
 
 		 363 aa  219  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  41.3 
 
 		 393 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  43.13 
 
 		 381 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  41.57 
 
 		 393 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  39.4 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  42.2 
 
 		 395 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  38.37 
 
 		 351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  39.51 
 
 		 352 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  38.07 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  38.07 
 
 		 351 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  38.95 
 
 		 359 aa  215  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  41.43 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  38.27 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  42.76 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  41.43 
 
 		 475 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  37.91 
 
 		 406 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  41.43 
 
 		 475 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  39.83 
 
 		 468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  41.34 
 
 		 358 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  42.94 
 
 		 397 aa  212  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  42.41 
 
 		 390 aa  212  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  37.96 
 
 		 352 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  42.99 
 
 		 373 aa  212  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  37.96 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  37.96 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  41.07 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  41.25 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  42.77 
 
 		 365 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  40.86 
 
 		 358 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  42.16 
 
 		 354 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  40.95 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  44.95 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  39.88 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  36.2 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  39.38 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  39.4 
 
 		 366 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  37.32 
 
 		 366 aa  205  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  42.9 
 
 		 344 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 364 aa  204  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 358 aa  203  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  39.6 
 
 		 460 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  39.71 
 
 		 460 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 		 411 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  37.92 
 
 		 351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  39.14 
 
 		 374 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  37.09 
 
 		 355 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  38.41 
 
 		 351 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 		 444 aa  199  6e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  40.18 
 
 		 373 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  39.16 
 
 		 358 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  40 
 
 		 356 aa  198  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  38.91 
 
 		 363 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  35.73 
 
 		 443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  37.28 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  42.59 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  39.3 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  36.94 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  40.92 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  39.94 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  39.23 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  39.23 
 
 		 364 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  40.65 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  39.23 
 
 		 364 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  38.64 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  38.91 
 
 		 363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  38.64 
 
 		 349 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  35.82 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  39.05 
 
 		 358 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  37.85 
 
 		 352 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  39.1 
 
 		 372 aa  196  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  37.24 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  39.66 
 
 		 402 aa  196  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 374 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  39.94 
 
 		 374 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 374 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  39.56 
 
 		 456 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>