More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6560 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  77.75 
 
 		 470 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  98.48 
 
 		 460 aa  905    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  76.88 
 
 		 475 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 460 aa  920    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  76.88 
 
 		 475 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  85.19 
 
 		 468 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  68.55 
 
 		 393 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0468  putative multidrug resistance protein  72.34 
 
 		 395 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0883  multidrug resistance protein, putative  72.34 
 
 		 395 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1802  HlyD family secretion protein  75 
 
 		 395 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0690  putative multidrug resistance protein  72.34 
 
 		 395 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1644  HlyD family secretion protein  75 
 
 		 395 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1624  HlyD family secretion protein  74.8 
 
 		 395 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1408  putative multidrug resistance protein  72.34 
 
 		 395 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38199  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  49.72 
 
 		 401 aa  349  8e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  53.8 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  52.02 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  49.44 
 
 		 363 aa  312  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  37.22 
 
 		 334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  36.16 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  39.9 
 
 		 400 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  35.87 
 
 		 366 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 366 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  38.12 
 
 		 374 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  39.28 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  36.9 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  37.85 
 
 		 366 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  37.94 
 
 		 343 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  38.53 
 
 		 375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  41.14 
 
 		 375 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  36.45 
 
 		 364 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  39.27 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  35.78 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  34.76 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  36.81 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  33.14 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.61 
 
 		 365 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  37.8 
 
 		 368 aa  193  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  35.97 
 
 		 443 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  40.64 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  41.82 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  38.75 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  39.38 
 
 		 390 aa  190  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  43.12 
 
 		 363 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 374 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  36.86 
 
 		 347 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  41.59 
 
 		 363 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  35.18 
 
 		 400 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  38.3 
 
 		 346 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 		 363 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  35.43 
 
 		 370 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  38.11 
 
 		 394 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  34.99 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  36.59 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  35.41 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  38.34 
 
 		 348 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  37.74 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 		 364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  35.08 
 
 		 402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  41.28 
 
 		 364 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 		 364 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  35.06 
 
 		 349 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  38.04 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  42.07 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  36.45 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  34.56 
 
 		 347 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  39.27 
 
 		 390 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  39.57 
 
 		 350 aa  180  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  36.62 
 
 		 351 aa  179  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  36.04 
 
 		 351 aa  179  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34 
 
 		 387 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34 
 
 		 387 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  34.77 
 
 		 391 aa  179  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  37.69 
 
 		 378 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  33.05 
 
 		 344 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 325 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  39.58 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  33.24 
 
 		 355 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  35.74 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  34.01 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  38.06 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  35.6 
 
 		 369 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  33.05 
 
 		 351 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  35.59 
 
 		 358 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  37.36 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  40.17 
 
 		 372 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  32.4 
 
 		 375 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  35.07 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  34.2 
 
 		 391 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  40.49 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  40.58 
 
 		 372 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2377  secretion protein HlyD family protein  41.56 
 
 		 348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  37.04 
 
 		 395 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.64 
 
 		 352 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.64 
 
 		 352 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2289  secretion protein HlyD family protein  41.56 
 
 		 348 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.64 
 
 		 352 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  38.69 
 
 		 372 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  40.31 
 
 		 388 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  36.31 
 
 		 342 aa  173  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>