More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2004 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 380 aa  776    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  45.65 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  45.65 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  44.65 
 
 		 391 aa  333  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  43.88 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  43.68 
 
 		 393 aa  332  6e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  45.82 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  46.24 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  46.38 
 
 		 404 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  46.38 
 
 		 404 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  46.38 
 
 		 404 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  46.05 
 
 		 397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  46.51 
 
 		 405 aa  328  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  49.55 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.725166 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02540  multidrug efflux system  49.55 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  49.55 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  49.55 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02505  hypothetical protein  49.55 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  49.55 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  49.55 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  49.55 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  46.49 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  43.54 
 
 		 402 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  46.11 
 
 		 420 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  45.58 
 
 		 404 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  45.6 
 
 		 413 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0890  efflux pump membrane protein  44.48 
 
 		 391 aa  324  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0249504  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  43.48 
 
 		 391 aa  323  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  45.33 
 
 		 424 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  43.16 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  45.27 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3191  multidrug resistance protein A  48.95 
 
 		 390 aa  320  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168067  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  45.04 
 
 		 411 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  45.04 
 
 		 411 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  45.04 
 
 		 411 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  44.59 
 
 		 406 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  44.32 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  44.77 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  44.77 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  44.77 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  45.64 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  42.66 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  44.5 
 
 		 410 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  44.77 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  44.57 
 
 		 390 aa  314  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  42.63 
 
 		 390 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  42.63 
 
 		 390 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  42.63 
 
 		 390 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  42.51 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01156  multidrug resistance efflux pump  43.53 
 
 		 372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  45.58 
 
 		 390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  45.58 
 
 		 390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  45.58 
 
 		 390 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  45.58 
 
 		 390 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  45.58 
 
 		 390 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2518  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  45.48 
 
 		 387 aa  308  9e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3599  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  46.48 
 
 		 387 aa  308  9e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0273562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02278  EmrKY-TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component  45.48 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1289  efflux pump membrane protein  45.48 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  46.86 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02239  hypothetical protein  45.48 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1301  efflux pump membrane protein  45.48 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.632829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2505  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  45.48 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.012377  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2654  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  45.2 
 
 		 387 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4889  HlyD family secretion protein  43.15 
 
 		 459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.392756  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1634  secretion protein HlyD family protein  44.5 
 
 		 453 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.975133  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1214  secretion protein HlyD family protein  43.05 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.314397  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1293  multidrug resistance A (translocase) transmembrane protein  43.05 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.538155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1123  secretion protein HlyD family protein  43.05 
 
 		 429 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.911317  normal  0.519674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2078  secretion protein HlyD family protein  44 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2416  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 		 437 aa  298  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.975538 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2021  secretion protein HlyD family protein  42.59 
 
 		 413 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4314  MFS efflux pump, membrane fusion protein, EmrA subfamily  43.35 
 
 		 423 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4021  secretion protein HlyD family protein  43.85 
 
 		 451 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0262  secretion protein HlyD family protein  42.49 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  44.07 
 
 		 444 aa  293  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0257  secretion protein HlyD family protein  42.49 
 
 		 402 aa  292  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0859  secretion protein HlyD  43.53 
 
 		 402 aa  289  7e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556695  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1288  secretion protein HlyD family protein  42.12 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  42.34 
 
 		 405 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3490  secretion protein HlyD family protein  42.89 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3743  secretion protein HlyD family protein  45.53 
 
 		 453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00143217  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3235  secretion protein HlyD  42.26 
 
 		 465 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.265062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5574  secretion protein HlyD family protein  43.43 
 
 		 480 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6205  secretion protein HlyD  42.24 
 
 		 450 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127149  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4219  secretion protein HlyD family protein  44.01 
 
 		 386 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.439503  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0460  multidrug resistance protein  37.53 
 
 		 403 aa  254  1.0000000000000001e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1825  multidrug resistance protein  44.57 
 
 		 489 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.996701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0732  multidrug resistance secretion protein  44.57 
 
 		 489 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1013  putative multidrug resistance protein  44.57 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0925  multidrug resistance protein  44.57 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1914  multidrug resistance efflux pump  44.57 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0192  multidrug resistance protein A  44.57 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0717  putative multidrug resistance protein  44.57 
 
 		 457 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.053035  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1416  multidrug resistance protein  44.57 
 
 		 457 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304514  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0456  multidrug resistance protein  44.57 
 
 		 457 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1987  putative multidrug resistance protein  44.57 
 
 		 457 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0847932  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0464  putative multidrug resistance protein  44.57 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0368  multidrug resistance protein  44.57 
 
 		 489 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2100  multidrug resistance protein  44.57 
 
 		 489 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>