More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3279 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  100 
 
 		 385 aa  772    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  66.18 
 
 		 383 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  62.39 
 
 		 413 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  60.94 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  57.85 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  57.27 
 
 		 394 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  48.61 
 
 		 380 aa  310  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  53.87 
 
 		 354 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  49.38 
 
 		 414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  53.55 
 
 		 352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  48.66 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  45.97 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  49.21 
 
 		 342 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  47.51 
 
 		 358 aa  289  6e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  50.88 
 
 		 358 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  48.05 
 
 		 358 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  51.18 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  50.3 
 
 		 353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  46.96 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  48.73 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  49.57 
 
 		 358 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  50 
 
 		 346 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  50.89 
 
 		 367 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  47.06 
 
 		 390 aa  275  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  48.73 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  50.77 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  46.29 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  46.31 
 
 		 372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  47.65 
 
 		 358 aa  273  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  48.42 
 
 		 363 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  45.56 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  45.56 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  45.56 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  50.59 
 
 		 353 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  48.1 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  47.45 
 
 		 349 aa  266  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  47.19 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  44.41 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  46.25 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  45.45 
 
 		 372 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  46.83 
 
 		 360 aa  262  6.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  48.26 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  48.07 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  45.19 
 
 		 393 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  45.18 
 
 		 375 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  45.92 
 
 		 390 aa  259  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  43.52 
 
 		 366 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  44.48 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  48.59 
 
 		 400 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  44.88 
 
 		 422 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  46.88 
 
 		 383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  41.59 
 
 		 406 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  44.31 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  43.53 
 
 		 373 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  42.18 
 
 		 365 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  45.01 
 
 		 374 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  45.01 
 
 		 374 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  45.01 
 
 		 374 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  51.15 
 
 		 344 aa  249  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  41.77 
 
 		 404 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  44.41 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  41 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  44.44 
 
 		 425 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  43.67 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  40.41 
 
 		 355 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  45.32 
 
 		 374 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  43.4 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  42.42 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  45.09 
 
 		 377 aa  242  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  44.08 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  43.27 
 
 		 373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  44.79 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  40.11 
 
 		 352 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  44.79 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  44.79 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  44.13 
 
 		 371 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  41.44 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  44.05 
 
 		 355 aa  237  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  38.94 
 
 		 352 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  38.94 
 
 		 352 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  38.94 
 
 		 352 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  38.94 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  40.94 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  42.19 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 351 aa  233  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 351 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  47.91 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  41.59 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  42.28 
 
 		 349 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  38.35 
 
 		 411 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  46.89 
 
 		 397 aa  229  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  40.68 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  41.52 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  41.59 
 
 		 402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  46.03 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  41.61 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  40.88 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  39.44 
 
 		 364 aa  224  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>