More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1703 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 358 aa  712    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  67.89 
 
 		 358 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  62.15 
 
 		 358 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  51.79 
 
 		 354 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  52.12 
 
 		 352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  51.33 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  50 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  46.29 
 
 		 358 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  51.92 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  52.21 
 
 		 367 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  51.92 
 
 		 353 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  47.98 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  47.58 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  47.4 
 
 		 358 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  47.27 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  46.43 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  47.01 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  46.75 
 
 		 394 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  46.69 
 
 		 342 aa  258  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  43.2 
 
 		 349 aa  255  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  46.27 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  45.27 
 
 		 413 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  48.54 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  41.54 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  42.35 
 
 		 414 aa  238  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  45.48 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  43.18 
 
 		 383 aa  235  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  47.87 
 
 		 396 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  41.06 
 
 		 380 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  43.54 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  40.65 
 
 		 378 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  44.67 
 
 		 344 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  38.31 
 
 		 344 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  40.31 
 
 		 373 aa  209  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  36.8 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  43.13 
 
 		 377 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  36.33 
 
 		 351 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  38.95 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  39.74 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  36.33 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.21 
 
 		 387 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34.21 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  40.94 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  37.79 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  39.75 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  44.34 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  39.34 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  40.33 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  34.74 
 
 		 404 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  36.69 
 
 		 344 aa  192  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  37.32 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  39.02 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  35.4 
 
 		 406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  38.66 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  37.32 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 		 371 aa  189  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 365 aa  189  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  37.35 
 
 		 368 aa  189  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  38.69 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  36.19 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  38.69 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  37.32 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  39.52 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  38.69 
 
 		 364 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  38.69 
 
 		 364 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  39.55 
 
 		 386 aa  186  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  39.02 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  37.24 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  36.72 
 
 		 346 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  38.14 
 
 		 344 aa  182  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.07 
 
 		 352 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.07 
 
 		 352 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.07 
 
 		 352 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.07 
 
 		 352 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  37.18 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  41.2 
 
 		 400 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  33.05 
 
 		 364 aa  179  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  34.2 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  34.52 
 
 		 422 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  39.87 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  37.85 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  36.16 
 
 		 456 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  37.42 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  33.54 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  32.95 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  38.51 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  36.15 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  32.33 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  40.2 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  33.51 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  35.69 
 
 		 369 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  34.69 
 
 		 411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 393 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  35.48 
 
 		 366 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  36.97 
 
 		 366 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  36.2 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  37.13 
 
 		 397 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  34.37 
 
 		 402 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  38.31 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>