More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2257 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 341 aa  674    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  40.24 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 351 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  39.63 
 
 		 352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  39.63 
 
 		 352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  39.63 
 
 		 351 aa  242  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  39.63 
 
 		 352 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  39.63 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  39.33 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  40.42 
 
 		 380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  39.82 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  38.39 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  40.31 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  39.46 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  39.81 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  42.27 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  40.62 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  40.38 
 
 		 350 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  38.36 
 
 		 351 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  42.3 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  40.18 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.21 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 366 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  41.07 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  36.42 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  38.69 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  36.64 
 
 		 355 aa  209  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  37.81 
 
 		 414 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  36.42 
 
 		 387 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  39.51 
 
 		 349 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  36.81 
 
 		 355 aa  209  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  39.02 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  36.44 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  40.14 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  38.07 
 
 		 413 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  37.43 
 
 		 390 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  39.08 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  38.01 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  37.11 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  37.38 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  35.54 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  37.38 
 
 		 363 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  40.48 
 
 		 373 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  37.06 
 
 		 364 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  37.06 
 
 		 364 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  37.06 
 
 		 364 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  38.84 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  37.3 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  37.7 
 
 		 363 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  39.34 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  39.7 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  38.3 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  39.48 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  36.59 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  36.59 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  37.7 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  38.18 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  36.42 
 
 		 364 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  37.58 
 
 		 360 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  40.66 
 
 		 354 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  36.28 
 
 		 422 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  37.74 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  38.81 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  38.92 
 
 		 378 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  36.72 
 
 		 354 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  38.48 
 
 		 383 aa  193  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  34.22 
 
 		 349 aa  192  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  41.1 
 
 		 354 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  35.33 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  31.9 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  35.33 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  37.83 
 
 		 456 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  34.02 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  36.45 
 
 		 353 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  36.47 
 
 		 373 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  38.69 
 
 		 382 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  36.28 
 
 		 404 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  37.86 
 
 		 375 aa  189  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  37.84 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  36.98 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  38.39 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  37.94 
 
 		 355 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  35.74 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  37.95 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  36.23 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  37.66 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  37.66 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  37.66 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  36.63 
 
 		 375 aa  186  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 358 aa  186  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  36.76 
 
 		 372 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  36.54 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  36.39 
 
 		 367 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  35.08 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  37.12 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  36.71 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  36.45 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  35.17 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>