More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0452 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 375 aa  738    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  58.06 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  54.19 
 
 		 380 aa  356  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  54.39 
 
 		 377 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  54.71 
 
 		 360 aa  345  8e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  52.43 
 
 		 385 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  52.02 
 
 		 387 aa  339  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  50.75 
 
 		 349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  50.45 
 
 		 349 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  54.12 
 
 		 397 aa  325  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  52.68 
 
 		 355 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  51.67 
 
 		 350 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  44.38 
 
 		 467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  54.65 
 
 		 377 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  44.09 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  51.92 
 
 		 358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  44.3 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  50.45 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  53.8 
 
 		 358 aa  297  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  50.61 
 
 		 386 aa  294  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  45.43 
 
 		 348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  48.41 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  38.12 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  38.94 
 
 		 414 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  41.86 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  42.62 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  40.65 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  37.22 
 
 		 375 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  38.6 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  39.25 
 
 		 378 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  41.75 
 
 		 385 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.71 
 
 		 344 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  37.72 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.71 
 
 		 355 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  41.94 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  41.37 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  39.25 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  41.75 
 
 		 371 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  39.24 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  40.53 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  40.06 
 
 		 404 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 		 392 aa  186  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 351 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  34.9 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  34.47 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  35 
 
 		 351 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  39.76 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  39.69 
 
 		 360 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  36.07 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  35.93 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 		 358 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 		 374 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  39.09 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  38.26 
 
 		 363 aa  179  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 390 aa  179  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  41.44 
 
 		 390 aa  179  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  35.57 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  35.57 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  40.22 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  37.68 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  35.57 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  39.2 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  39.87 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 353 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  38.31 
 
 		 354 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  37.86 
 
 		 341 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  35.28 
 
 		 352 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  36.77 
 
 		 363 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  38.08 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  39.01 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  37.5 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  36.77 
 
 		 363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  35.19 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 381 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  35.65 
 
 		 349 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  41.18 
 
 		 371 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 358 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  36.45 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  37.67 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  36.45 
 
 		 364 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  36.45 
 
 		 364 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  38.17 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  37.1 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  35.16 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  36.86 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  40.52 
 
 		 394 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  37.73 
 
 		 377 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 358 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  34.43 
 
 		 422 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  38.17 
 
 		 367 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  40.39 
 
 		 374 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  38.21 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  36.25 
 
 		 350 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  35.88 
 
 		 346 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  39.04 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>