More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0117 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  100 
 
 
333 aa  674    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  42.49 
 
 
355 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  43.57 
 
 
350 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  40.54 
 
 
349 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  40.54 
 
 
349 aa  257  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 
385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  40.79 
 
 
380 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  40.91 
 
 
354 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  39.59 
 
 
377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 
358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  36.81 
 
 
385 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  38.53 
 
 
444 aa  226  6e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  38.3 
 
 
360 aa  225  9e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  36.31 
 
 
387 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  35.99 
 
 
467 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 
377 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  36.94 
 
 
463 aa  219  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  36.44 
 
 
348 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 
397 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  35.59 
 
 
386 aa  209  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  37.43 
 
 
358 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  37.81 
 
 
375 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  37.74 
 
 
390 aa  186  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  34.97 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  33.14 
 
 
344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  35.49 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  32.84 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  34.21 
 
 
383 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  33.33 
 
 
348 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  33.12 
 
 
390 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  33.54 
 
 
352 aa  159  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  34.49 
 
 
356 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  33.72 
 
 
351 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  32.13 
 
 
372 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  32.51 
 
 
414 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  31.5 
 
 
377 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  33.64 
 
 
390 aa  155  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  32.17 
 
 
351 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  32.17 
 
 
351 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  33.87 
 
 
352 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  37.22 
 
 
383 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  31.96 
 
 
351 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  33.87 
 
 
352 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  33.77 
 
 
363 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  33.44 
 
 
397 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  33.87 
 
 
352 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  33.87 
 
 
352 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  34.97 
 
 
351 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  29.53 
 
 
347 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  34.31 
 
 
342 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  33.11 
 
 
371 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  34.63 
 
 
358 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  34.64 
 
 
351 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  32.55 
 
 
380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  32.21 
 
 
404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  31.83 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  32.26 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  32.15 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  34.64 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  32.4 
 
 
350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  32.25 
 
 
371 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  33.01 
 
 
387 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  33.01 
 
 
387 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  32.04 
 
 
372 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  33.12 
 
 
394 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  33.65 
 
 
385 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  31.14 
 
 
475 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  31.14 
 
 
470 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  32.45 
 
 
366 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  31.14 
 
 
475 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  32.37 
 
 
393 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  32.32 
 
 
349 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  31.47 
 
 
372 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  33.63 
 
 
367 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  33.77 
 
 
390 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  31.73 
 
 
382 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  30.82 
 
 
352 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  33.77 
 
 
390 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  32.84 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  30.28 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  30.36 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  32.68 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  33.33 
 
 
390 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  33.65 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  32.14 
 
 
354 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  30.93 
 
 
375 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  30.19 
 
 
375 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  32.84 
 
 
373 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  33.77 
 
 
390 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  33.33 
 
 
390 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  33.33 
 
 
390 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  31.35 
 
 
400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  32.25 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  33.77 
 
 
349 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  32.82 
 
 
413 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  33 
 
 
390 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  33 
 
 
390 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  29.3 
 
 
370 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  29.97 
 
 
460 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  33.93 
 
 
353 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>