More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1211 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 386 aa  772    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  60.64 
 
 		 397 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  50.6 
 
 		 349 aa  335  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  50.6 
 
 		 349 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  52.99 
 
 		 354 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  51.34 
 
 		 350 aa  322  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  47.01 
 
 		 385 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  50.29 
 
 		 358 aa  310  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  47.79 
 
 		 355 aa  308  8e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  48.06 
 
 		 377 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  48.06 
 
 		 360 aa  305  8.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  42.82 
 
 		 467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  42.82 
 
 		 463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  50.78 
 
 		 375 aa  303  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  46.13 
 
 		 380 aa  299  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  45.97 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  45.84 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  50.27 
 
 		 358 aa  293  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  45.59 
 
 		 348 aa  285  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  41.35 
 
 		 444 aa  276  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  47.86 
 
 		 377 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  46.58 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  40.27 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  38.7 
 
 		 375 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  42.14 
 
 		 390 aa  225  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  39.14 
 
 		 414 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  39.69 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  36.76 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  40.39 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  41.11 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  37.17 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  40.43 
 
 		 373 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  38.44 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  41.01 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  36.93 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  40.55 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  39.46 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  37.92 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 366 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.59 
 
 		 365 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  38.87 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  40.82 
 
 		 356 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  37.93 
 
 		 378 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  40.74 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  38.07 
 
 		 413 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  36.5 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  36.5 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  36.9 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  37.65 
 
 		 348 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  38.31 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  37.72 
 
 		 358 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.62 
 
 		 387 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  36.5 
 
 		 351 aa  196  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  40.32 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 342 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34.81 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  40 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  41 
 
 		 353 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.12 
 
 		 352 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  39.37 
 
 		 371 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  38.92 
 
 		 372 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.12 
 
 		 352 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.12 
 
 		 352 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  38.11 
 
 		 355 aa  192  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  39.71 
 
 		 367 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.12 
 
 		 352 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  39.34 
 
 		 363 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  39.71 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  40.33 
 
 		 374 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  36.26 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  39.67 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  39.55 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  37.91 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  37.91 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  40.33 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  40.33 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  37.91 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  36.28 
 
 		 352 aa  190  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  36.66 
 
 		 351 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  39.02 
 
 		 363 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  37.54 
 
 		 349 aa  189  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  39.34 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  38.69 
 
 		 364 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  38.69 
 
 		 364 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  37.84 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  37.07 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  39.42 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  36.55 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  36.62 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  37.17 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  37.03 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  35.67 
 
 		 381 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  33.53 
 
 		 368 aa  185  9e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  37.34 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  38.92 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>