More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04271 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  100 
 
 		 358 aa  711    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  59.22 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  58.2 
 
 		 385 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  58.81 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  56.06 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  60.06 
 
 		 377 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  50.88 
 
 		 360 aa  325  9e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  51.18 
 
 		 349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  51.18 
 
 		 349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  49.72 
 
 		 467 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  51.79 
 
 		 355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  55.41 
 
 		 375 aa  312  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  51.33 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  53.45 
 
 		 386 aa  310  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  51.98 
 
 		 354 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  49.86 
 
 		 463 aa  308  8e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  50.3 
 
 		 385 aa  303  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  52.94 
 
 		 397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  48.7 
 
 		 444 aa  292  7e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  50.77 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  49.7 
 
 		 358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  43.67 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  36.44 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  39 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  42.39 
 
 		 342 aa  202  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  38.18 
 
 		 413 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  36.94 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  41.26 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  41.3 
 
 		 390 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.04 
 
 		 355 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  37.82 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  37.46 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  38.41 
 
 		 344 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  41.2 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  37.18 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  40.61 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  35.95 
 
 		 351 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.58 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34.58 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  38.44 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  40.39 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  40.2 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  38.74 
 
 		 373 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  36.92 
 
 		 414 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 		 351 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  39 
 
 		 363 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  36.55 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  38.51 
 
 		 348 aa  188  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  40.86 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  38.67 
 
 		 363 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  38.58 
 
 		 351 aa  186  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  40.17 
 
 		 344 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 364 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  38.76 
 
 		 364 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 364 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  37.92 
 
 		 400 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  36.58 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  39.16 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  38.53 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  37.65 
 
 		 352 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  37.65 
 
 		 352 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  37.65 
 
 		 352 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  38.11 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  37.65 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  38.23 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  34.6 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  34.27 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  36.08 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  36.07 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  37.54 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  39.17 
 
 		 377 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  37.19 
 
 		 378 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  36.73 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  36.77 
 
 		 391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  32.51 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  37.21 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  35.23 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  37.36 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  35.23 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  40.26 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  35.23 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  33.74 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  34.75 
 
 		 374 aa  169  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  36.9 
 
 		 393 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  33.63 
 
 		 422 aa  169  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  34.46 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  38.17 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  35.94 
 
 		 460 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  35.94 
 
 		 460 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  35.04 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  34.77 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  34.72 
 
 		 370 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  35.52 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 		 402 aa  165  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  35.06 
 
 		 468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  33.64 
 
 		 413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>