More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3837 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  100 
 
 		 391 aa  777    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  59.01 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  59.3 
 
 		 404 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  56.72 
 
 		 402 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  50.39 
 
 		 411 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  55.19 
 
 		 413 aa  362  6e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  44.7 
 
 		 368 aa  301  9e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  46.6 
 
 		 402 aa  293  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  46.58 
 
 		 411 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  45.62 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  44.36 
 
 		 401 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  45.89 
 
 		 421 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  45.61 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  42.82 
 
 		 456 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  45 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  49.56 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  45.51 
 
 		 419 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  47.02 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  42.32 
 
 		 408 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  39 
 
 		 380 aa  236  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  41.88 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 		 358 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  39.57 
 
 		 380 aa  232  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  41.03 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  38.53 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  42.24 
 
 		 350 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  41.59 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  38.82 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  38.82 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  38.37 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  38.82 
 
 		 352 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  41.96 
 
 		 373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  38.08 
 
 		 351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  38.08 
 
 		 351 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  38.82 
 
 		 352 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  38.55 
 
 		 351 aa  222  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  41.46 
 
 		 414 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  37.54 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  39.59 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  38.19 
 
 		 352 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  39.47 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  37.08 
 
 		 383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  38.18 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  36.92 
 
 		 394 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  42.49 
 
 		 365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  36.96 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  39.29 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  34.62 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  39.24 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  37.95 
 
 		 372 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  34.74 
 
 		 393 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  35.49 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  38.24 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  38.32 
 
 		 363 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  35.26 
 
 		 385 aa  203  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  41.48 
 
 		 363 aa  203  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  37.64 
 
 		 392 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  32 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  37.22 
 
 		 366 aa  202  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  39.52 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  36.54 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  32.46 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  38.71 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  38.75 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  40.32 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  36.42 
 
 		 354 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  37.82 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  40.84 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  36.67 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  38.71 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  38.71 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  34.45 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  35.6 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  34.33 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  32.65 
 
 		 351 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  40.51 
 
 		 364 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  40.51 
 
 		 363 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  40.51 
 
 		 364 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  39.29 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  39.42 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  40.19 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  39.31 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  39.31 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  39.31 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  37.32 
 
 		 374 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  37.32 
 
 		 374 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  37.32 
 
 		 374 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  36.87 
 
 		 371 aa  193  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  31.68 
 
 		 390 aa  192  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  37.19 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  35.87 
 
 		 349 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1021  multidrug resistance protein VceA  36.46 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  35.59 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  40.75 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  38.48 
 
 		 393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>