More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4061 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 422 aa  833    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  82.97 
 
 		 419 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  80.95 
 
 		 411 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  69.45 
 
 		 408 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  72.13 
 
 		 456 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  53.96 
 
 		 393 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  54.09 
 
 		 402 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  53.42 
 
 		 397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  51.7 
 
 		 421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  48.72 
 
 		 401 aa  306  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  53.77 
 
 		 401 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  44.9 
 
 		 391 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  45.98 
 
 		 411 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  48.99 
 
 		 402 aa  297  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  45.59 
 
 		 404 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  45.29 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  52.35 
 
 		 405 aa  289  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  46.99 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  40.7 
 
 		 368 aa  266  7e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  43.72 
 
 		 413 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  42.73 
 
 		 383 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  41.07 
 
 		 394 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  45.56 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  44.35 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  41.55 
 
 		 390 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  43.17 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  42.24 
 
 		 394 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  40.11 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  41.25 
 
 		 350 aa  233  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  42.24 
 
 		 385 aa  233  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  39.89 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  42.57 
 
 		 373 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.13 
 
 		 344 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  35.92 
 
 		 355 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  36.44 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  40.45 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  39.67 
 
 		 373 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  41.98 
 
 		 372 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  37.83 
 
 		 380 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  39.63 
 
 		 414 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  37.36 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  36.89 
 
 		 349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  42.3 
 
 		 373 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  35.96 
 
 		 351 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  40.41 
 
 		 371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  40 
 
 		 383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  41.93 
 
 		 374 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  41.93 
 
 		 374 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  40.05 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  41.93 
 
 		 374 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  36.78 
 
 		 383 aa  212  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.6 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  36.62 
 
 		 366 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  36.02 
 
 		 349 aa  210  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  35.21 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  37.43 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  40.26 
 
 		 354 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  40.61 
 
 		 363 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  36.59 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  38.51 
 
 		 381 aa  207  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  39.87 
 
 		 352 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  39.64 
 
 		 349 aa  206  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  36.87 
 
 		 352 aa  203  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  38.05 
 
 		 422 aa  203  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  41.67 
 
 		 377 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 363 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  39.95 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  37.81 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  42.25 
 
 		 372 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  35.94 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  35.84 
 
 		 352 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  35.84 
 
 		 352 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  35.92 
 
 		 390 aa  201  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  35.84 
 
 		 352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  36.18 
 
 		 351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48280  putative multidrug resistance efflux pump  40.49 
 
 		 383 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0160418  normal  0.0591644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  38.44 
 
 		 378 aa  199  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  36.07 
 
 		 351 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  39.33 
 
 		 382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  44 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  38.03 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  38.73 
 
 		 364 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  38.73 
 
 		 364 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  40.68 
 
 		 364 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  35.78 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  38.41 
 
 		 364 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  36.45 
 
 		 404 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  35.71 
 
 		 372 aa  196  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  37.78 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  37.35 
 
 		 358 aa  196  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  39.05 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  37.71 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  38.31 
 
 		 353 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  42.81 
 
 		 344 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  35.44 
 
 		 368 aa  192  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>