More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2735 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 349 aa  692    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  72.86 
 
 		 387 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  72.86 
 
 		 387 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  72.29 
 
 		 351 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  73.28 
 
 		 349 aa  501  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  72.81 
 
 		 355 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  73.39 
 
 		 344 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  43.2 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  43.85 
 
 		 390 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  43.8 
 
 		 364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 380 aa  239  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  45.95 
 
 		 348 aa  238  8e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  43.33 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  38.37 
 
 		 354 aa  236  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  41.89 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  40.95 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  40.95 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  40.95 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  41.25 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  41.25 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  42.05 
 
 		 413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  43.29 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  40.95 
 
 		 352 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  41.88 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  42.59 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  42.02 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  42.28 
 
 		 385 aa  226  7e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  40.4 
 
 		 366 aa  225  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  41.9 
 
 		 414 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  42.41 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  40.5 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  40.35 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  40.7 
 
 		 375 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  40.64 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  44.3 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  38.37 
 
 		 358 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  40.89 
 
 		 342 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  39.12 
 
 		 350 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  37.99 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  39.12 
 
 		 374 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  39.77 
 
 		 373 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  40.64 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  41.29 
 
 		 358 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  42.22 
 
 		 378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  39.19 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  37.87 
 
 		 383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 353 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  39.48 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  39 
 
 		 363 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  39 
 
 		 363 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  38.94 
 
 		 383 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  38.8 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  38.66 
 
 		 358 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  38.96 
 
 		 390 aa  208  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  38.37 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  39.82 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  37.3 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  38.42 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  38.11 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  38.11 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  38.62 
 
 		 372 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  36.83 
 
 		 375 aa  206  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  38.79 
 
 		 373 aa  206  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  38.98 
 
 		 364 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  34.58 
 
 		 411 aa  205  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  39.94 
 
 		 374 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 374 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 374 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  39.65 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  39.71 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  37.03 
 
 		 393 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  34.64 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  39.42 
 
 		 367 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  37.74 
 
 		 421 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  37.54 
 
 		 411 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 353 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  43.97 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  36.58 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  36.39 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  36.49 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  38.35 
 
 		 365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  38.17 
 
 		 402 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  41.42 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  37.79 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  40.78 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  35.26 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  38.32 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  37.69 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  36.89 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  39 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  35.24 
 
 		 404 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  35.69 
 
 		 413 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  39.38 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  39.81 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  38.1 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  37.18 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  37.24 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  34.67 
 
 		 406 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>