More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5419 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 385 aa  764    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  57.55 
 
 		 375 aa  355  5e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  51.36 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  52.62 
 
 		 377 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 360 aa  327  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  51.06 
 
 		 349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  51.06 
 
 		 349 aa  319  5e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  53.15 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  47.87 
 
 		 387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  47.99 
 
 		 385 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  49.42 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  50.58 
 
 		 355 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  49.55 
 
 		 350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  50.59 
 
 		 358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  49.56 
 
 		 348 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  45.35 
 
 		 467 aa  298  8e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  52.62 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  48.62 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  44.79 
 
 		 463 aa  293  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  42.01 
 
 		 444 aa  289  6e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  48.17 
 
 		 358 aa  276  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  48.36 
 
 		 360 aa  259  8e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  39.94 
 
 		 333 aa  246  6e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 		 414 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  39.33 
 
 		 375 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  39.88 
 
 		 355 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  39.88 
 
 		 344 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  38.59 
 
 		 390 aa  202  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  39.48 
 
 		 390 aa  202  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  38.82 
 
 		 354 aa  202  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  38.69 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  40.96 
 
 		 373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  35.73 
 
 		 380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  40.81 
 
 		 390 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  40.51 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  37.31 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  36.74 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  36.21 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  36.83 
 
 		 351 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  37.47 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  38.19 
 
 		 364 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  35.73 
 
 		 366 aa  192  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  39.13 
 
 		 348 aa  190  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  39.55 
 
 		 381 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  39.74 
 
 		 383 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  38.41 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  35.87 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  36.01 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  39.61 
 
 		 356 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  39.38 
 
 		 378 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  38.95 
 
 		 394 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  39.41 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  38.83 
 
 		 352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  39.22 
 
 		 360 aa  182  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  37.87 
 
 		 342 aa  182  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  37.3 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  37.14 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  36.59 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  38.31 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  36.51 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  35.06 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  38.54 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  39.02 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  34.08 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  38.46 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  39.16 
 
 		 349 aa  176  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  33.96 
 
 		 359 aa  176  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  40.69 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  42.48 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  36.53 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  37.01 
 
 		 364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  38.83 
 
 		 358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  35.37 
 
 		 355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  37.01 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  35 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  35.12 
 
 		 387 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  36.01 
 
 		 351 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  36.69 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  38.36 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  34.77 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  38.39 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  38.68 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  38.22 
 
 		 382 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  37.94 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  36.42 
 
 		 373 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  39.94 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  37.35 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  36.59 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  35.45 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  32.42 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>