More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0524 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  90.4 
 
 		 351 aa  547  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  91.06 
 
 		 351 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  90.73 
 
 		 351 aa  547  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  87.79 
 
 		 352 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  87.79 
 
 		 352 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  87.79 
 
 		 352 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  87.46 
 
 		 352 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  75.58 
 
 		 352 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  74.75 
 
 		 351 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  73.04 
 
 		 364 aa  435  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  72.82 
 
 		 358 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  63.91 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  45.12 
 
 		 390 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  44.25 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  44.09 
 
 		 355 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  44.09 
 
 		 344 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  41.49 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  42.25 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  43.58 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  45.14 
 
 		 365 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  43.97 
 
 		 349 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  42.21 
 
 		 372 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  42.16 
 
 		 344 aa  208  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  44.44 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  39.52 
 
 		 393 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  42.81 
 
 		 375 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  40 
 
 		 393 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  42.36 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  40.14 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  40.85 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  38.65 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  42.96 
 
 		 400 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  42.91 
 
 		 383 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  40.46 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  39.18 
 
 		 421 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  40.62 
 
 		 377 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  41.08 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  40.07 
 
 		 397 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  42.21 
 
 		 373 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  41.46 
 
 		 373 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  42.16 
 
 		 364 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  39.38 
 
 		 406 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  41.87 
 
 		 374 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  41.87 
 
 		 374 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  41.87 
 
 		 374 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  38.68 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  39.04 
 
 		 404 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  38.98 
 
 		 356 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  42.95 
 
 		 373 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  41.05 
 
 		 375 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 366 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  41.81 
 
 		 364 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 413 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  42.76 
 
 		 374 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  40.89 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  41.81 
 
 		 364 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  41.81 
 
 		 372 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  41.81 
 
 		 364 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  38.41 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003356  multidrug resistance efflux pump  40.3 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000276837  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  41.81 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  36.42 
 
 		 390 aa  189  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  41.46 
 
 		 363 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  41.11 
 
 		 363 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  38.06 
 
 		 354 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  38.49 
 
 		 411 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  37.15 
 
 		 383 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  38.33 
 
 		 401 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  39.24 
 
 		 369 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  39.53 
 
 		 385 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  42.14 
 
 		 363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  38 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  37.98 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  39 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  35.49 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  38.49 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  40.33 
 
 		 349 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  40.33 
 
 		 349 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  37.89 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  36.82 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  40.21 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 382 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  39.8 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  37.37 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  38.54 
 
 		 404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  39.51 
 
 		 394 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  36.33 
 
 		 366 aa  178  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  37.63 
 
 		 374 aa  178  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  40.42 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  36.79 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  38.68 
 
 		 385 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  37.14 
 
 		 411 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  39.1 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  38.23 
 
 		 391 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  37.59 
 
 		 358 aa  176  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  37.23 
 
 		 358 aa  176  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  38.49 
 
 		 346 aa  175  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>