More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1772 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  95.35 
 
 		 387 aa  703    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  100 
 
 		 385 aa  770    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  74.37 
 
 		 380 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  71.63 
 
 		 377 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  71.31 
 
 		 377 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  60.65 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  54.68 
 
 		 350 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  52.25 
 
 		 349 aa  356  3.9999999999999996e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  51.95 
 
 		 349 aa  354  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  52.96 
 
 		 355 aa  352  5e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  53.69 
 
 		 354 aa  345  7e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  58.2 
 
 		 358 aa  342  9e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  55.8 
 
 		 375 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  51.38 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  45.55 
 
 		 385 aa  316  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  45.94 
 
 		 467 aa  311  9e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  45.31 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  45.38 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  51.94 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  45.59 
 
 		 348 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  48.33 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  46.77 
 
 		 360 aa  265  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  37.39 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  40.58 
 
 		 413 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  39.3 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  40.36 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  42.15 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  38.5 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  41.67 
 
 		 342 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  39.14 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  37.87 
 
 		 380 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  42.14 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  37.3 
 
 		 354 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  38.95 
 
 		 366 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  40.42 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  41.11 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  37.63 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  38.26 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  42.51 
 
 		 377 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  38.16 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  38.27 
 
 		 414 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.4 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  39.81 
 
 		 356 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.65 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.79 
 
 		 344 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  40.56 
 
 		 348 aa  199  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  39.81 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  39.55 
 
 		 385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  36.15 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  39.69 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  35.2 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  39.87 
 
 		 393 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  34.1 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  37.93 
 
 		 355 aa  193  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  38.11 
 
 		 364 aa  192  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  39.62 
 
 		 401 aa  192  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  38.27 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  39.2 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  38.24 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  40.31 
 
 		 350 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  37.47 
 
 		 372 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 421 aa  190  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  38.15 
 
 		 402 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  36.64 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  37.4 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  34.41 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  38.42 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  35.76 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  40.44 
 
 		 363 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  35.29 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  39.27 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.94 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  36.88 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  39.29 
 
 		 363 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  36.39 
 
 		 382 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  38.24 
 
 		 402 aa  186  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  36.19 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  36.17 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  36.53 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  38.83 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  33.82 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  38.31 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  36.22 
 
 		 391 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 		 372 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  36.04 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.61 
 
 		 352 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  36.47 
 
 		 374 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  39.12 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  38.29 
 
 		 397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.61 
 
 		 352 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.61 
 
 		 352 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  37.84 
 
 		 381 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  38.55 
 
 		 374 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  38.55 
 
 		 374 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.61 
 
 		 352 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  36.69 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  37.46 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>