More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2304 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 358 aa  723    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  67.89 
 
 		 358 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  63.97 
 
 		 358 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  55.94 
 
 		 354 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  56.91 
 
 		 352 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  51.39 
 
 		 358 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  53.37 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  53.08 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  52.76 
 
 		 358 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  51.59 
 
 		 356 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  52.79 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  51.54 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  52.79 
 
 		 367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  49.85 
 
 		 383 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  45.48 
 
 		 349 aa  280  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  50.89 
 
 		 394 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  52.49 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  46.46 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  49.83 
 
 		 342 aa  271  9e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  47.18 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  48.07 
 
 		 394 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  47.65 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  50.16 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  47.08 
 
 		 396 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  46.41 
 
 		 344 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  45.18 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  42.17 
 
 		 414 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  40.41 
 
 		 380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  42.81 
 
 		 383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  43.18 
 
 		 392 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  43.4 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  45.51 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  43.04 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  42.99 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  40.32 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  42.9 
 
 		 377 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  41.88 
 
 		 390 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  36.69 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  41.08 
 
 		 371 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  36.39 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  36.74 
 
 		 387 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  36.74 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  39.26 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  37.7 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  40.69 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  41.69 
 
 		 363 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  40.69 
 
 		 363 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  37.29 
 
 		 393 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  40.45 
 
 		 372 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  39.24 
 
 		 366 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  39.23 
 
 		 371 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  38.33 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  38.51 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  40.32 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  40.39 
 
 		 364 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  40.39 
 
 		 364 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  40.19 
 
 		 373 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  40.91 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  41.37 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  38.66 
 
 		 375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  40.18 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  40.06 
 
 		 364 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  38.83 
 
 		 346 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  40.19 
 
 		 372 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  37.65 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  41.42 
 
 		 382 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  33.52 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  32.63 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  36.22 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  40.32 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  39.68 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  40.32 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  34.74 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  40.32 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  37.86 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  34.74 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  40.45 
 
 		 397 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  35.78 
 
 		 348 aa  186  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  33.13 
 
 		 404 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  33.91 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  35.69 
 
 		 355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  36.83 
 
 		 374 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  35.01 
 
 		 354 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  36.73 
 
 		 344 aa  182  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  32.86 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  40.62 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  35.65 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  33.99 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  32.86 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  32.86 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  40.62 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  40.62 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  36.02 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  32.86 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  35.74 
 
 		 341 aa  180  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>