More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4511 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 397 aa  785    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  50.99 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  53.27 
 
 		 383 aa  322  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  48.72 
 
 		 400 aa  322  6e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  50.14 
 
 		 382 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  50.14 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  51 
 
 		 373 aa  311  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  50.85 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  51.89 
 
 		 381 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  50.59 
 
 		 373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  52.5 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  52.5 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  52.5 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  58.54 
 
 		 388 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  45.83 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  45.09 
 
 		 383 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  44.99 
 
 		 413 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  46.6 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  46.89 
 
 		 385 aa  255  9e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  44.34 
 
 		 414 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  42.22 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  44.23 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  45.91 
 
 		 378 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  45.5 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  43.3 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  43.82 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  43.3 
 
 		 363 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  43.49 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  39.24 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  39.76 
 
 		 355 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  43.75 
 
 		 363 aa  242  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  43.22 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  43.22 
 
 		 364 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  43.22 
 
 		 364 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  42.68 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  43.64 
 
 		 356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  45.45 
 
 		 350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  42.99 
 
 		 393 aa  233  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  45.56 
 
 		 353 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  44.63 
 
 		 374 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  44.63 
 
 		 374 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  44.63 
 
 		 374 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  43.99 
 
 		 375 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  43.63 
 
 		 400 aa  229  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  40.35 
 
 		 375 aa  229  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  44.28 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  39.7 
 
 		 352 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  39.14 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  41.38 
 
 		 342 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  41.59 
 
 		 358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  43.02 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  42.3 
 
 		 380 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  42.72 
 
 		 373 aa  226  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  40.58 
 
 		 349 aa  226  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  42.17 
 
 		 422 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  42.51 
 
 		 358 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  43.87 
 
 		 346 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  44.57 
 
 		 367 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  41.16 
 
 		 344 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  36.76 
 
 		 349 aa  219  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  41.81 
 
 		 363 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  38.22 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  39.44 
 
 		 390 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  36.29 
 
 		 351 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  41.9 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  41.92 
 
 		 358 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  38.35 
 
 		 413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  39.71 
 
 		 358 aa  216  8e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  37.65 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  35.39 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  35.11 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  43.04 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  39.36 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  44.57 
 
 		 353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  41.74 
 
 		 352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  42.9 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  41.43 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  41.21 
 
 		 352 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  41.25 
 
 		 333 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  40.57 
 
 		 354 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  40.12 
 
 		 467 aa  208  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  41.37 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  39.06 
 
 		 383 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  37.86 
 
 		 358 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 		 406 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  39.4 
 
 		 352 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  39.4 
 
 		 352 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  39.4 
 
 		 352 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  43 
 
 		 358 aa  206  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  39.1 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  39.4 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  43.23 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  38.81 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  39.1 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  39.4 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>