More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1354 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 349 aa  716    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  45.22 
 
 		 355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  41.87 
 
 		 347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  42.21 
 
 		 375 aa  262  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  42.27 
 
 		 366 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  40.28 
 
 		 359 aa  249  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  40.88 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  36.59 
 
 		 347 aa  225  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  39 
 
 		 370 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  36.16 
 
 		 369 aa  219  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  36.14 
 
 		 366 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  35.84 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  37.84 
 
 		 366 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  38.14 
 
 		 375 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  39.26 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  37.16 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  35.65 
 
 		 406 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  37.06 
 
 		 343 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  36.26 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  34.35 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  34.8 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  32.34 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  34.44 
 
 		 404 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  39.07 
 
 		 331 aa  190  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  34.08 
 
 		 393 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  36.04 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  37.69 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  36.7 
 
 		 390 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 		 352 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 		 352 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  32.08 
 
 		 393 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  32.62 
 
 		 372 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  34.81 
 
 		 401 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.2 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  35.06 
 
 		 460 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  34.56 
 
 		 460 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  31.2 
 
 		 374 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  36.94 
 
 		 363 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  35.29 
 
 		 383 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  36.18 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  31.65 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  35.03 
 
 		 397 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  36.78 
 
 		 385 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  36.62 
 
 		 364 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  36.31 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  36.31 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  36.31 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  36.31 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  36.31 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  36.67 
 
 		 363 aa  179  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  34.93 
 
 		 373 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 		 351 aa  179  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  34.88 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7028  secretion protein HlyD family protein  36.89 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146297  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  35.31 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  33.87 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  34.88 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  35.49 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  36.26 
 
 		 394 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  33.75 
 
 		 360 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1467  secretion protein HlyD  37.1 
 
 		 342 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0027674  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6361  secretion protein HlyD family protein  37.1 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  33.24 
 
 		 467 aa  176  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  34.29 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  35.37 
 
 		 352 aa  176  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  34.07 
 
 		 390 aa  175  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  32.56 
 
 		 463 aa  175  9e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  34.97 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  34.34 
 
 		 372 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  34.17 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  35.74 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  31.48 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  33.14 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  32.04 
 
 		 468 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  33.43 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  33.72 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  35.69 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  35.53 
 
 		 332 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  32.75 
 
 		 402 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  33.53 
 
 		 387 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  32.52 
 
 		 470 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  32.91 
 
 		 414 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  32.45 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  31.87 
 
 		 348 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  32.52 
 
 		 475 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  33.74 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  35.8 
 
 		 372 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  32.52 
 
 		 475 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  35.16 
 
 		 394 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  33.12 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  34.48 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  32.56 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  32.93 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  32.39 
 
 		 380 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  33.97 
 
 		 350 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 358 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>