More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3091 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 334 aa  687    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  46.57 
 
 		 372 aa  316  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  47.02 
 
 		 374 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  45.21 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  44.86 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  45.21 
 
 		 366 aa  296  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  43.03 
 
 		 375 aa  288  9e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  46.93 
 
 		 368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  36.26 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 		 395 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  37.22 
 
 		 460 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  37.22 
 
 		 460 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  40.34 
 
 		 331 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  35.51 
 
 		 470 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  35.51 
 
 		 475 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  35.51 
 
 		 475 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  35.31 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  35.44 
 
 		 410 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  31.65 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  39.68 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  36.11 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  37.06 
 
 		 422 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  35.23 
 
 		 468 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1624  HlyD family secretion protein  34.08 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0883  multidrug resistance protein, putative  34.08 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1802  HlyD family secretion protein  34.08 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1408  putative multidrug resistance protein  34.08 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38199  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1644  HlyD family secretion protein  34.08 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0690  putative multidrug resistance protein  34.08 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0468  putative multidrug resistance protein  34.08 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  37.58 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  37.35 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  33.98 
 
 		 400 aa  196  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  35.85 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  34.99 
 
 		 369 aa  195  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  36.17 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  36.78 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  36.5 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  36.8 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  36.17 
 
 		 397 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 402 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  35.48 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  36.5 
 
 		 400 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  36.44 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  31.75 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  36.5 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  32.59 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  35.28 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  35.49 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 380 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  33.72 
 
 		 394 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  34.04 
 
 		 413 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  35.58 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  33.13 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  37.74 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  34.11 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  32.91 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  32.84 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  34.6 
 
 		 375 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  34.5 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  32.6 
 
 		 405 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  32.83 
 
 		 351 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  34.23 
 
 		 429 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  35.2 
 
 		 363 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  34.65 
 
 		 343 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  34.03 
 
 		 352 aa  186  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  35.28 
 
 		 374 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  37.58 
 
 		 385 aa  186  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  35.53 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  35.86 
 
 		 363 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  36.95 
 
 		 332 aa  185  8e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  36.51 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  35.8 
 
 		 410 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  36.42 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  36.36 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  32.76 
 
 		 375 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  32.23 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  35.21 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  34.02 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  35.21 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  36.9 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  35.21 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  35.74 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  35.2 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  35.2 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  35.2 
 
 		 363 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  34.55 
 
 		 391 aa  183  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  34.62 
 
 		 406 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  34.03 
 
 		 391 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  35.2 
 
 		 364 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  35.5 
 
 		 404 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  35.5 
 
 		 404 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  35.5 
 
 		 404 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 411 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1123  secretion protein HlyD family protein  33.84 
 
 		 429 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.911317  normal  0.519674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2078  secretion protein HlyD family protein  37.7 
 
 		 397 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 411 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>