More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3793 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 356 aa  712    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  49.85 
 
 		 371 aa  297  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  49.37 
 
 		 349 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  39.23 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  37.82 
 
 		 407 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  40.37 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  39.52 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  38.44 
 
 		 351 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  38.91 
 
 		 351 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  38.91 
 
 		 351 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  37.25 
 
 		 354 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  36.5 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2237  membrane fusion protein (MFP) family protein  41.94 
 
 		 368 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0912  secretion protein HlyD family protein  41.94 
 
 		 368 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.659301  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1890  secretion protein HlyD family protein  36.28 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0616  secretion protein HlyD  35.87 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  37.96 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  38.25 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  37.85 
 
 		 401 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  35.1 
 
 		 385 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  36.55 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  34.71 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  37.05 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  37.65 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  36.9 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  36.83 
 
 		 404 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  37.99 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  36.83 
 
 		 404 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  36.9 
 
 		 407 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  38.48 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  33.44 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  37.66 
 
 		 394 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  36.83 
 
 		 404 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  38.73 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  36.34 
 
 		 407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  33.12 
 
 		 344 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  38.24 
 
 		 397 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  37.13 
 
 		 411 aa  182  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.51 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  35.01 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  36.8 
 
 		 410 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  34.81 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34.31 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  34.02 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  37.81 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  36.75 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2257  secretion protein HlyD family protein  40.32 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.250908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  35.35 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  37.93 
 
 		 397 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  33.23 
 
 		 349 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  36.16 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  35.56 
 
 		 372 aa  179  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  35.81 
 
 		 443 aa  179  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  37.27 
 
 		 406 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  35.91 
 
 		 411 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  36.92 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  35.91 
 
 		 411 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  33.8 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  35.91 
 
 		 411 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  35.2 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  34.44 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  36.1 
 
 		 468 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  36.57 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  36.57 
 
 		 475 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  36.57 
 
 		 475 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2688  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 361 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  35.61 
 
 		 411 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  35.61 
 
 		 411 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  35.61 
 
 		 411 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  35.61 
 
 		 411 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  37 
 
 		 404 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  34.89 
 
 		 352 aa  176  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  33.72 
 
 		 405 aa  175  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1853  multidrug resistance transmembrane protein  37.95 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  36.96 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3490  secretion protein HlyD family protein  35.94 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  32.16 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  37.75 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  36.78 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  33.61 
 
 		 359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  35.07 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  33.84 
 
 		 331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  33.24 
 
 		 352 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  37.31 
 
 		 366 aa  173  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  33.24 
 
 		 352 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  33.24 
 
 		 352 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  35.29 
 
 		 368 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  34.07 
 
 		 349 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2078  secretion protein HlyD family protein  38.41 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1144  secretion protein HlyD family protein  36.17 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143245  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  35.4 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  37.54 
 
 		 402 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  34.59 
 
 		 348 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  31.55 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  36.05 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  36.05 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  33.73 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  35.45 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  33.14 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>