More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0912 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2237  membrane fusion protein (MFP) family protein  98.91 
 
 
368 aa  727    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0912  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
368 aa  733    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.659301  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2257  secretion protein HlyD family protein  85.6 
 
 
368 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.250908 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  53 
 
 
383 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  38.73 
 
 
413 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  38.73 
 
 
407 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  46.39 
 
 
371 aa  239  8e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  42.13 
 
 
364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  43.9 
 
 
349 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 
351 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 
351 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  37.17 
 
 
351 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0616  secretion protein HlyD  37.73 
 
 
388 aa  216  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  42.31 
 
 
356 aa  215  9e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  35.96 
 
 
354 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2688  secretion protein HlyD family protein  43.58 
 
 
361 aa  209  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  40.29 
 
 
375 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  35.65 
 
 
385 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  35.37 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  35.8 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  35.45 
 
 
389 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1890  secretion protein HlyD family protein  35.47 
 
 
368 aa  189  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  35.96 
 
 
352 aa  186  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  35.51 
 
 
380 aa  186  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  37.31 
 
 
349 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  34.5 
 
 
351 aa  179  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 
387 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  34.08 
 
 
352 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  34.08 
 
 
352 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  37.08 
 
 
372 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  34.82 
 
 
391 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 
387 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  33.43 
 
 
391 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  34.08 
 
 
352 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  32.76 
 
 
402 aa  176  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  33.92 
 
 
351 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  34.08 
 
 
352 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  35.92 
 
 
393 aa  176  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  33.8 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  33.63 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  34.36 
 
 
351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0890  efflux pump membrane protein  35.1 
 
 
391 aa  173  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0249504  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  36.39 
 
 
410 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  37.1 
 
 
397 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  37.05 
 
 
404 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  37.72 
 
 
411 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  37.72 
 
 
411 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  35.82 
 
 
404 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  37.72 
 
 
411 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  37.72 
 
 
411 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  34.2 
 
 
364 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  34.78 
 
 
391 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  37.72 
 
 
411 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  37.72 
 
 
411 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  37.72 
 
 
411 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 
404 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  36.59 
 
 
350 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  36.75 
 
 
404 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0262  secretion protein HlyD family protein  38.17 
 
 
405 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  36.47 
 
 
344 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  34.71 
 
 
355 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 
404 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  37.16 
 
 
366 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  36.75 
 
 
407 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  37.62 
 
 
366 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  36.04 
 
 
405 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  36.76 
 
 
420 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  35.82 
 
 
406 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  36.52 
 
 
397 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 
349 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0257  secretion protein HlyD family protein  37.9 
 
 
402 aa  169  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  37.11 
 
 
390 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  36.1 
 
 
413 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  34.12 
 
 
351 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  34.83 
 
 
331 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  37.32 
 
 
374 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  33.33 
 
 
390 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  33.33 
 
 
390 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  38.05 
 
 
460 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  35.78 
 
 
402 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  34.84 
 
 
368 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  34.99 
 
 
390 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  36.14 
 
 
405 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  38.12 
 
 
460 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3743  secretion protein HlyD family protein  37.22 
 
 
453 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00143217  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  35.9 
 
 
444 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  36.15 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  35.88 
 
 
429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  33.06 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  35.26 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  36.14 
 
 
407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  36.16 
 
 
380 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  36.44 
 
 
365 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  38.01 
 
 
390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  33.72 
 
 
358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  36.56 
 
 
348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  35.37 
 
 
344 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  33.33 
 
 
375 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4219  secretion protein HlyD family protein  35.8 
 
 
386 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.439503  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  34.53 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>