More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1920 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  100 
 
 		 383 aa  776    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2237  membrane fusion protein (MFP) family protein  54.83 
 
 		 368 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0912  secretion protein HlyD family protein  54.05 
 
 		 368 aa  348  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.659301  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2257  secretion protein HlyD family protein  56.06 
 
 		 368 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.250908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  38.37 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  38.37 
 
 		 351 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  37.79 
 
 		 351 aa  258  9e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  43.12 
 
 		 364 aa  256  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  39.02 
 
 		 413 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  38.44 
 
 		 407 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  41.98 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2688  secretion protein HlyD family protein  44.21 
 
 		 361 aa  237  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  39.52 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  37.61 
 
 		 366 aa  232  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  36.67 
 
 		 387 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0616  secretion protein HlyD  38.02 
 
 		 388 aa  219  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  35.2 
 
 		 354 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  36.92 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  40.49 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  36.53 
 
 		 389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  36.36 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  36.06 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  38.4 
 
 		 375 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1890  secretion protein HlyD family protein  33.71 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  38.55 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0262  secretion protein HlyD family protein  38.98 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0257  secretion protein HlyD family protein  39.6 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  38.6 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  35.21 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  36.67 
 
 		 413 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  34.23 
 
 		 352 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  37.13 
 
 		 341 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  37.14 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  36.99 
 
 		 444 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  36.1 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  38.01 
 
 		 406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  38 
 
 		 406 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  37.94 
 
 		 411 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  38.64 
 
 		 311 aa  189  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  37.94 
 
 		 411 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  37.94 
 
 		 411 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  34.9 
 
 		 405 aa  189  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  37.94 
 
 		 411 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  37.65 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  35.29 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  35.29 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  37.71 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  38.55 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  37.65 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  37.65 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  37.83 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  37.65 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  36.55 
 
 		 413 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  34.12 
 
 		 352 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  34.12 
 
 		 352 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  34.12 
 
 		 352 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  35.33 
 
 		 380 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  35.46 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  37.65 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  35.07 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  35.07 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  35.07 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  34.12 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  36.89 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  36.89 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  34.12 
 
 		 351 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  36.17 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0890  efflux pump membrane protein  35.65 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0249504  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  34.12 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  36.92 
 
 		 404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  37.15 
 
 		 400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  36.92 
 
 		 404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  36.92 
 
 		 404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  36.36 
 
 		 350 aa  182  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  34.41 
 
 		 364 aa  182  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  36.19 
 
 		 374 aa  182  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  35.39 
 
 		 355 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  35.53 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  36.81 
 
 		 424 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  33.83 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  33.88 
 
 		 411 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  38.27 
 
 		 397 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  35.69 
 
 		 344 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  37.06 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  35.12 
 
 		 443 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  35.5 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  38.27 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  38.46 
 
 		 390 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  34.38 
 
 		 390 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  34.46 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  35.73 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  33.62 
 
 		 391 aa  176  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  35.05 
 
 		 368 aa  175  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  34.3 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  37.78 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  34.67 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  36.05 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  32.94 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  37.13 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  34.5 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>