More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4053 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 349 aa  702    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  48.78 
 
 		 356 aa  278  7e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  47.02 
 
 		 371 aa  272  5.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2237  membrane fusion protein (MFP) family protein  44.92 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0912  secretion protein HlyD family protein  44.59 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.659301  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  40.84 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2257  secretion protein HlyD family protein  43.61 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.250908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  36.81 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  36.99 
 
 		 351 aa  206  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  36.47 
 
 		 366 aa  193  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  35.35 
 
 		 413 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  32.52 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  41.16 
 
 		 372 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 		 347 aa  189  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0616  secretion protein HlyD  35.96 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  36.36 
 
 		 385 aa  189  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  37.57 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  37.13 
 
 		 406 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  35.81 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  36.42 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  37.01 
 
 		 411 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  37.01 
 
 		 411 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  37.01 
 
 		 411 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  37.01 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  37.01 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  34 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  37.01 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  37.01 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  36.75 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  38.18 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  38.18 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  35.81 
 
 		 389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  36.47 
 
 		 404 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  36.47 
 
 		 404 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  35.78 
 
 		 424 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  36.47 
 
 		 404 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2688  secretion protein HlyD family protein  40.62 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  36.84 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  36.18 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  36 
 
 		 404 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 407 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  38.24 
 
 		 368 aa  179  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  34.02 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1144  secretion protein HlyD family protein  39.18 
 
 		 374 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143245  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  36.81 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  33.23 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  37.19 
 
 		 397 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  36.57 
 
 		 395 aa  176  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  37.3 
 
 		 395 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  36.71 
 
 		 375 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  34.57 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  34.57 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  34.57 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  35.21 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  35.44 
 
 		 400 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  32.62 
 
 		 331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  34.08 
 
 		 400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  34.43 
 
 		 352 aa  173  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  35.14 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0859  secretion protein HlyD  38.32 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  34.89 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  37.04 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  36.11 
 
 		 390 aa  170  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  34.51 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  36.51 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  36.23 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1890  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 368 aa  169  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  33.8 
 
 		 443 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  33.96 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  37.58 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  37.21 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  35.12 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  35.03 
 
 		 390 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  38.08 
 
 		 372 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  35.03 
 
 		 390 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  35.33 
 
 		 390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  36.36 
 
 		 350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  32.94 
 
 		 355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  35.03 
 
 		 390 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  32.56 
 
 		 405 aa  165  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  35.03 
 
 		 390 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  34.23 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  34.23 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  34.23 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  35.1 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  36.31 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  34.23 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3743  secretion protein HlyD family protein  35.26 
 
 		 453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00143217  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  35.1 
 
 		 475 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  35.1 
 
 		 475 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  34.23 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>