More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000902 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  100 
 
 		 311 aa  629  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  92.93 
 
 		 341 aa  559  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  47.1 
 
 		 354 aa  278  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  39.74 
 
 		 331 aa  228  9e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  39.41 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  38.14 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  38.14 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  36.63 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  37.66 
 
 		 355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  38.64 
 
 		 383 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 366 aa  182  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  36.18 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  35.28 
 
 		 355 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  34.23 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0616  secretion protein HlyD  36.21 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  36.17 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  34.97 
 
 		 344 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  35 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  38.08 
 
 		 385 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  36.13 
 
 		 351 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  34 
 
 		 407 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  34 
 
 		 413 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  34.85 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  34.65 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  34.95 
 
 		 351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  31.25 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  35.11 
 
 		 352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  35.11 
 
 		 352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  35.48 
 
 		 351 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  34.32 
 
 		 366 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  37.27 
 
 		 395 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  35.11 
 
 		 352 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  36.54 
 
 		 366 aa  172  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  33.85 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  32.63 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  35.11 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  35.79 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  36.22 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  37.78 
 
 		 393 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  35.53 
 
 		 443 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  35.85 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  35.29 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  37.04 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  34.37 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  35.76 
 
 		 333 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  35.53 
 
 		 365 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  34.17 
 
 		 351 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  32.82 
 
 		 387 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  38.93 
 
 		 400 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  32.72 
 
 		 387 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  33.86 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  36.69 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  34.8 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  34.45 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  33.86 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  35.69 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  35.83 
 
 		 414 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  36.91 
 
 		 380 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  34.58 
 
 		 344 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  33.94 
 
 		 349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 406 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  35.4 
 
 		 390 aa  165  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  34.66 
 
 		 364 aa  165  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  33.94 
 
 		 349 aa  165  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  35.24 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  33.54 
 
 		 380 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  33.54 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  32.67 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  36.11 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  36.16 
 
 		 413 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  35.1 
 
 		 390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  35.79 
 
 		 422 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  35.89 
 
 		 378 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 		 383 aa  162  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 394 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  36.12 
 
 		 389 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2237  membrane fusion protein (MFP) family protein  36.25 
 
 		 368 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  35.09 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  35.38 
 
 		 460 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  35.38 
 
 		 460 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0912  secretion protein HlyD family protein  36.25 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.659301  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  34.98 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  36.93 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  34.65 
 
 		 363 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  36 
 
 		 470 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  36 
 
 		 475 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  36 
 
 		 475 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  33.03 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  37.14 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  33.75 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  32.49 
 
 		 400 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  37.54 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02278  EmrKY-TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component  35 
 
 		 387 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1289  efflux pump membrane protein  35 
 
 		 387 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2518  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  35 
 
 		 387 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02239  hypothetical protein  35 
 
 		 387 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2505  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  35 
 
 		 387 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.012377  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1301  efflux pump membrane protein  35 
 
 		 387 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.632829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  35.8 
 
 		 396 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>