More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4510 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4510  multidrug resistance protein MdtN  100 
 
 		 349 aa  699    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803564  normal  0.0531786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4352  multidrug resistance protein MdtN  80.23 
 
 		 349 aa  567  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4577  multidrug resistance protein MdtN  63.9 
 
 		 349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603811  hitchhiker  0.0000103156 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  64.47 
 
 		 349 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3647  multidrug resistance protein MdtN  64.47 
 
 		 349 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00582079  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  64.18 
 
 		 349 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4112  multidrug resistance protein MdtN  63.9 
 
 		 349 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  64.47 
 
 		 349 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  63.61 
 
 		 349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2193  multidrug resistance protein MdtN  60.23 
 
 		 350 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2119  multidrug resistance protein MdtN  60.17 
 
 		 349 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0195  multidrug resistance protein MdtN  57.31 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0296812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  52.38 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  52.38 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  52.38 
 
 		 349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0241  multidrug resistance protein MdtN  49.11 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  35.44 
 
 		 351 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  36.71 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  36.71 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  36.71 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  36.39 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  36.08 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  36.39 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  36.39 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  36.39 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  31.12 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  33.74 
 
 		 321 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  31.56 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2656  secretion protein HlyD  32.93 
 
 		 326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  30.79 
 
 		 347 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  30.51 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  30.31 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  30.52 
 
 		 366 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  31.11 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  29.79 
 
 		 289 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  30.46 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  30.09 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  30.82 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  30.82 
 
 		 366 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  28.81 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  30.5 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  30.7 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  27.63 
 
 		 373 aa  119  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  30.15 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  32.8 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  28.4 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0272  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  29.97 
 
 		 321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  29.15 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0263  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  30.58 
 
 		 321 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  28.76 
 
 		 288 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  28.91 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  31.86 
 
 		 334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  31.52 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03101  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  27.38 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3537  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.38 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03052  hypothetical protein  27.38 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  27.96 
 
 		 364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0465  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.38 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.08 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  32.28 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  31.63 
 
 		 385 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.38 
 
 		 310 aa  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0912  secretion protein HlyD family protein  35.03 
 
 		 368 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.659301  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  29.82 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2237  membrane fusion protein (MFP) family protein  34.71 
 
 		 368 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  29.82 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  31.6 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  31.6 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  26.14 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  29.82 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  28.82 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3678  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  28.13 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  29.25 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  25.84 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4558  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.38 
 
 		 309 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  29.52 
 
 		 291 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  25.84 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  25.84 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  29.35 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  24.92 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  25.99 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  28.03 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.83 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3663  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.83 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  32.91 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3628  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.83 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0802422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3725  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.83 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0948843 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.83 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  30.53 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.36 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  31.25 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  32.15 
 
 		 475 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  32.15 
 
 		 470 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  32.15 
 
 		 475 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  29.79 
 
 		 295 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  26.81 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  31.65 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  31.36 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>