More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0241 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0241  multidrug resistance protein MdtN  100 
 
 		 344 aa  684    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0195  multidrug resistance protein MdtN  51.5 
 
 		 362 aa  322  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0296812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4577  multidrug resistance protein MdtN  51.19 
 
 		 349 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603811  hitchhiker  0.0000103156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4112  multidrug resistance protein MdtN  51.19 
 
 		 349 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  50.6 
 
 		 349 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  50.3 
 
 		 349 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3647  multidrug resistance protein MdtN  50.3 
 
 		 349 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00582079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  50.3 
 
 		 349 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  50.3 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2193  multidrug resistance protein MdtN  47.77 
 
 		 350 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2119  multidrug resistance protein MdtN  49.85 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4352  multidrug resistance protein MdtN  49.4 
 
 		 349 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4510  multidrug resistance protein MdtN  49.11 
 
 		 349 aa  295  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803564  normal  0.0531786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  43.49 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  43.49 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  43.49 
 
 		 349 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  37.34 
 
 		 343 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  37.66 
 
 		 343 aa  203  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  37.66 
 
 		 343 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  37.66 
 
 		 343 aa  202  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  37.66 
 
 		 343 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  37.66 
 
 		 343 aa  202  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  37.34 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  37.34 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  35.8 
 
 		 351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  30.72 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  30.12 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  32.66 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  32.76 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  33.12 
 
 		 368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  28.94 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  31.91 
 
 		 374 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  32.45 
 
 		 372 aa  122  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  33.87 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  31.37 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  26.09 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  26.88 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  31.29 
 
 		 368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  32.48 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  32.75 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  30.52 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  31.05 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  28.27 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  26.27 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  28.27 
 
 		 286 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  28.11 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  29.6 
 
 		 302 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  28.03 
 
 		 383 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0272  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  29.31 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  30.46 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  28.66 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  29.6 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  30.2 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  29.79 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  27.61 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  29.29 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.96 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.96 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  32.37 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.21 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  29.09 
 
 		 285 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  27.51 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  29.09 
 
 		 285 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  29.09 
 
 		 285 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.21 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  31.86 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.21 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  31.86 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  29.09 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  29.45 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  29.46 
 
 		 286 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03101  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  27.21 
 
 		 310 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0465  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.21 
 
 		 310 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03052  hypothetical protein  27.21 
 
 		 310 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3537  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.21 
 
 		 310 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  32.33 
 
 		 361 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3663  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  28.01 
 
 		 310 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3725  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  28.01 
 
 		 310 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0948843 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  30.39 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 		 286 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3628  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  28.01 
 
 		 310 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0802422 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.94 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.62 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  28.94 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.79 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  28.94 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  31.68 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0420  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  29.51 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  26.93 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  27.08 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  28.62 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  30.72 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.64 
 
 		 358 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  28.23 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  28.82 
 
 		 354 aa  106  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  30.23 
 
 		 351 aa  106  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4558  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.21 
 
 		 309 aa  106  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  29.83 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1176  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  30.16 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>