More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4577 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  92.84 
 
 		 349 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3647  multidrug resistance protein MdtN  94.84 
 
 		 349 aa  663    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00582079  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  94.84 
 
 		 349 aa  663    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  93.12 
 
 		 349 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4112  multidrug resistance protein MdtN  99.14 
 
 		 349 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  94.84 
 
 		 349 aa  663    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4577  multidrug resistance protein MdtN  100 
 
 		 349 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603811  hitchhiker  0.0000103156 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4352  multidrug resistance protein MdtN  65.33 
 
 		 349 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4510  multidrug resistance protein MdtN  63.9 
 
 		 349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803564  normal  0.0531786 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2119  multidrug resistance protein MdtN  59.6 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2193  multidrug resistance protein MdtN  57.95 
 
 		 350 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0195  multidrug resistance protein MdtN  53.58 
 
 		 362 aa  362  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0296812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  49.52 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  49.52 
 
 		 349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  49.52 
 
 		 349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0241  multidrug resistance protein MdtN  51.19 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  38.06 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  38.39 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  38.39 
 
 		 343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  38.39 
 
 		 343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  38.39 
 
 		 343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  38.39 
 
 		 343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  38.39 
 
 		 343 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  38.06 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  35.78 
 
 		 351 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  33.74 
 
 		 289 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  31.63 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  31.02 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  33.54 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  33.95 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  33.95 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2656  secretion protein HlyD  33.54 
 
 		 326 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  32.05 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  33.23 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  31.23 
 
 		 288 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  28.83 
 
 		 366 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  31.55 
 
 		 385 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  28.61 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  29.08 
 
 		 354 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  29.69 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  29.38 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  33.23 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  27.65 
 
 		 359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  33.24 
 
 		 366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  29.67 
 
 		 374 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  28.49 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  27.83 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  31.18 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  31.27 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  29.34 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  30.09 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  31.61 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  29.81 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  29.81 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  29.81 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  29.81 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  32.68 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  29.81 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  28.78 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  30.65 
 
 		 288 aa  116  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  32.31 
 
 		 334 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  30.93 
 
 		 365 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  27.7 
 
 		 413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  29.5 
 
 		 285 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.5 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  29.5 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  30.21 
 
 		 288 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  31.08 
 
 		 389 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  28.87 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  29.5 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  29.04 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  30.56 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  33.55 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  29.61 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2255  secretion protein HlyD family protein  33.87 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  30.09 
 
 		 289 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  29.13 
 
 		 364 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  30.09 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  31.25 
 
 		 404 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  28.96 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2237  membrane fusion protein (MFP) family protein  32.31 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  33.83 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  24.77 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  24.77 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  30.03 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  30.72 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  27.32 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  33.43 
 
 		 475 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 		 475 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  30.99 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0912  secretion protein HlyD family protein  32.31 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.659301  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  27.43 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  24.77 
 
 		 287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  28.97 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  30.94 
 
 		 367 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  26.36 
 
 		 407 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  24.77 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  29.94 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  29.12 
 
 		 351 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>