More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4327 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  99.71 
 
 		 343 aa  684    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  99.42 
 
 		 343 aa  683    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  100 
 
 		 343 aa  686    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  99.71 
 
 		 343 aa  684    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  99.71 
 
 		 343 aa  684    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  99.42 
 
 		 343 aa  682    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  99.71 
 
 		 343 aa  684    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  99.13 
 
 		 343 aa  681    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  67.37 
 
 		 351 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  40.58 
 
 		 349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  40.58 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  40.58 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  39.01 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4577  multidrug resistance protein MdtN  38.41 
 
 		 349 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603811  hitchhiker  0.0000103156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4112  multidrug resistance protein MdtN  37.95 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  38.3 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  38.3 
 
 		 349 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3647  multidrug resistance protein MdtN  38.3 
 
 		 349 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00582079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  38.3 
 
 		 349 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4352  multidrug resistance protein MdtN  36.76 
 
 		 349 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2193  multidrug resistance protein MdtN  38.46 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2119  multidrug resistance protein MdtN  38.46 
 
 		 349 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0195  multidrug resistance protein MdtN  35.61 
 
 		 362 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0296812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0241  multidrug resistance protein MdtN  36.53 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4510  multidrug resistance protein MdtN  35.99 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803564  normal  0.0531786 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  32.72 
 
 		 331 aa  156  6e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  32.11 
 
 		 331 aa  152  8e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  32.39 
 
 		 285 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.39 
 
 		 285 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  32.39 
 
 		 285 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  32.08 
 
 		 285 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  33.02 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  32.67 
 
 		 366 aa  149  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  33.02 
 
 		 285 aa  149  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  33.02 
 
 		 285 aa  149  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  33.02 
 
 		 285 aa  149  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  33.02 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  33.04 
 
 		 364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  32.75 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  33.63 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  33.66 
 
 		 378 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  33.91 
 
 		 286 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  32.07 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  33.56 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  32.23 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  32.17 
 
 		 411 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  31.99 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  33.13 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  32.05 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  34.08 
 
 		 364 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  33.98 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  31.23 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  36.02 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  32.34 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  33.13 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  34.58 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  30.19 
 
 		 321 aa  133  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  31.85 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  30.38 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  31.85 
 
 		 286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  31.85 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  31.85 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  31.85 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  31.48 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  33.67 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  33.53 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  32.31 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  30.77 
 
 		 374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  29.14 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  30.09 
 
 		 463 aa  129  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  30.48 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  31.07 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  30.93 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  31.96 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  31.77 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  32.5 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  32.45 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  32.08 
 
 		 400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  31.16 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  30.32 
 
 		 401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  31.42 
 
 		 413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  29.68 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  30.9 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  31.23 
 
 		 380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  29.52 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  32.05 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  33.79 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  32.05 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  28.96 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  31.07 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  31.07 
 
 		 475 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  31.07 
 
 		 475 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  32.32 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  30.38 
 
 		 460 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  30.38 
 
 		 460 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  30.18 
 
 		 366 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  31.17 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  28.61 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  31.07 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0272  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  29.66 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>