More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001143 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  100 
 
 		 296 aa  601  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  39.86 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  40.89 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  39.51 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003310  fusaric acid resistance protein fusE  44.35 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.939405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  39.66 
 
 		 286 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  41.03 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  40.67 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  39.37 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  36.82 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  39.52 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  39.32 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  40.36 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  40.14 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  40 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  39.04 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  37.84 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  36.24 
 
 		 316 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  40 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  37.76 
 
 		 297 aa  188  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  35.84 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1367  secretion protein HlyD family protein  39.1 
 
 		 292 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455024  normal  0.947331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1328  secretion protein HlyD family protein  39.1 
 
 		 292 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  42.34 
 
 		 311 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  37.76 
 
 		 291 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  40.81 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  38.14 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.07 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  37.83 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.39 
 
 		 358 aa  182  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  37.91 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  38.93 
 
 		 334 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  37.98 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.36 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  39.02 
 
 		 351 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  38.16 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4754  secretion protein HlyD family protein  38.31 
 
 		 359 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0178648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  39.34 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2656  secretion protein HlyD  37.79 
 
 		 326 aa  178  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  37.37 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  38.03 
 
 		 292 aa  178  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  35.07 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5221  secretion protein HlyD family protein  37.93 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  37.11 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  37.17 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  37.17 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  34.36 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  38.28 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  34.59 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2628  HlyD family secretion protein  36.75 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.71 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1399  secretion protein HlyD family protein  37.45 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1542  secretion protein HlyD family protein  38.69 
 
 		 313 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1954  secretion protein HlyD  35.69 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  32.09 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  34.01 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1851  FusE  37.09 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  40.08 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  34.14 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  36.08 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1424  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48350  hypothetical protein  37.41 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707172  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  34.02 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  36.27 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  36.27 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  36.27 
 
 		 291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  34.6 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  38.04 
 
 		 317 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.52 
 
 		 314 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0964  secretion protein HlyD  37.76 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000197103  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1446  secretion protein HlyD family protein  37.76 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  31.76 
 
 		 287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  35.81 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  35.81 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0932  hypothetical protein  36.75 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0416  hypothetical protein  36.75 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0746  hypothetical protein  36.75 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1697  putative fusaric acid resistance protein  36.75 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420489  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1675  putative fusaric acid resistance protein  36.75 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1465  hypothetical protein  36.75 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  36.9 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  38.89 
 
 		 323 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  35.07 
 
 		 286 aa  172  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  35.86 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1869  secretion protein HlyD family protein  37.76 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  35.76 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  31.42 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  36.81 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  31.42 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  34.35 
 
 		 288 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  37.04 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  34.01 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.98 
 
 		 336 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  36.68 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  36.68 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  36.68 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  36.68 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  36.68 
 
 		 286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4156  hypothetical protein  38.2 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4082  secretion protein HlyD  37.12 
 
 		 294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>