More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1542 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1542  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 313 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  49.3 
 
 		 303 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  49.3 
 
 		 303 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  50.19 
 
 		 351 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.6 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5221  secretion protein HlyD family protein  50.38 
 
 		 359 aa  252  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011991 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.65 
 
 		 358 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  47.69 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4754  secretion protein HlyD family protein  50.78 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0178648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  49.32 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  50.34 
 
 		 292 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1399  secretion protein HlyD family protein  49.02 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  48.36 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  48.71 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  41.84 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  46.34 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  44.68 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  42.96 
 
 		 289 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  44.33 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  43.57 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  44.41 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  44.64 
 
 		 286 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  43.21 
 
 		 286 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  44.41 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4156  hypothetical protein  47.14 
 
 		 302 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  45.49 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  45.49 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  45.49 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.13 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  45.13 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  45.13 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  44.77 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  42.25 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  43.88 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  45.13 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  45.13 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  45.08 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  43.36 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  44.26 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  42.71 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48350  hypothetical protein  48.26 
 
 		 302 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707172  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  42.45 
 
 		 286 aa  218  8.999999999999998e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  45.77 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  42.76 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  43.25 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.77 
 
 		 315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  44.09 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1328  secretion protein HlyD family protein  48.28 
 
 		 292 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  44.01 
 
 		 337 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1367  secretion protein HlyD family protein  48.28 
 
 		 292 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455024  normal  0.947331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  47.93 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  45.58 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1954  secretion protein HlyD  44.56 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2628  HlyD family secretion protein  48.24 
 
 		 291 aa  208  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  43.26 
 
 		 289 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  45.53 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  45.53 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  42.29 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  45.53 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  45.53 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1697  putative fusaric acid resistance protein  48.23 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420489  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  45.53 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1675  putative fusaric acid resistance protein  48.23 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0932  hypothetical protein  48.23 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1851  FusE  48.23 
 
 		 291 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  43.84 
 
 		 289 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0746  hypothetical protein  48.23 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1465  hypothetical protein  48.23 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0416  hypothetical protein  48.23 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  41.98 
 
 		 295 aa  201  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  40.83 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  40.83 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  40.83 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  41.97 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  40.83 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  43.23 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  43.27 
 
 		 288 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  41.64 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  44.16 
 
 		 291 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.46 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  43.08 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  42.71 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0964  secretion protein HlyD  48.28 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000197103  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1446  secretion protein HlyD family protein  48.28 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1869  secretion protein HlyD family protein  48.44 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130815 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1424  secretion protein HlyD family protein  48.28 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  42.65 
 
 		 288 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  43.8 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  42.86 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  42.86 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  42.5 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.86 
 
 		 314 aa  192  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1821  hypothetical protein  46.18 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  43.92 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  42.45 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  37.99 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  39.07 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21290  hypothetical protein  45.8 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  41.41 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  41.64 
 
 		 331 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>