More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003310 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003310  fusaric acid resistance protein fusE  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.939405  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  44.35 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  40.35 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  38.96 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  36.05 
 
 		 334 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  41.13 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  41.13 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  39.51 
 
 		 327 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  38.53 
 
 		 289 aa  159  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 331 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  38.36 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  38.36 
 
 		 286 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  38.36 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  39.66 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  37.72 
 
 		 286 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  37.23 
 
 		 286 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  35.27 
 
 		 334 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  37.23 
 
 		 286 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  38.16 
 
 		 334 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  37.28 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  37.28 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.7 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  35.96 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  35.65 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  37.12 
 
 		 295 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 287 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  38.53 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 291 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 287 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 291 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 287 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  39.91 
 
 		 291 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 		 291 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  37.55 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  37.72 
 
 		 285 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  37.66 
 
 		 323 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  37.28 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  41.56 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  37.23 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  37.23 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  35.62 
 
 		 286 aa  149  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  37.12 
 
 		 288 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  36.8 
 
 		 324 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  37.23 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  36.21 
 
 		 284 aa  148  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  36.84 
 
 		 285 aa  148  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  37.23 
 
 		 331 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  37.28 
 
 		 285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1399  secretion protein HlyD family protein  36.21 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.84 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  36.84 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  36.4 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  36.84 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.83 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  38.53 
 
 		 317 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48350  hypothetical protein  35.65 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707172  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  36.24 
 
 		 288 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  38.16 
 
 		 305 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  37.87 
 
 		 288 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4156  hypothetical protein  36.21 
 
 		 302 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  35.5 
 
 		 294 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  35.09 
 
 		 302 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.6 
 
 		 336 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  34.8 
 
 		 293 aa  144  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21290  hypothetical protein  36.05 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.23 
 
 		 316 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  35.09 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  37.45 
 
 		 289 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  37.45 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  35.96 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  35.06 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4754  secretion protein HlyD family protein  33.91 
 
 		 359 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0178648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  39.66 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  36.17 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2656  secretion protein HlyD  33.59 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1821  hypothetical protein  35.32 
 
 		 285 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  36.24 
 
 		 288 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.2 
 
 		 344 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  36.17 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5221  secretion protein HlyD family protein  33.48 
 
 		 359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011991 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  38.6 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  34.2 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  37.99 
 
 		 292 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  35.78 
 
 		 286 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  35.78 
 
 		 286 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  38.53 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4082  secretion protein HlyD  37.28 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661784  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  34.51 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  36.4 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  35.34 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  36.6 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  35.47 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.67 
 
 		 358 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2255  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  38.16 
 
 		 291 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 300 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>