More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_21290 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_21290  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1821  hypothetical protein  98.6 
 
 		 285 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  69.12 
 
 		 288 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  68.09 
 
 		 284 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  69.47 
 
 		 289 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  69.61 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  69.82 
 
 		 288 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  52.98 
 
 		 289 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  52.88 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  47.2 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  49.47 
 
 		 285 aa  279  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  46.85 
 
 		 287 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  46.85 
 
 		 287 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  46.5 
 
 		 287 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  49.1 
 
 		 299 aa  275  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  50.54 
 
 		 302 aa  272  6e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.43 
 
 		 315 aa  268  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  51.24 
 
 		 286 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  49.47 
 
 		 286 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  50.88 
 
 		 286 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  49.12 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  49.12 
 
 		 286 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  50.9 
 
 		 308 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.82 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 316 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  51.77 
 
 		 292 aa  258  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  50.54 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  47.7 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  51.91 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  48.06 
 
 		 289 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  49.29 
 
 		 291 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1367  secretion protein HlyD family protein  50.88 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455024  normal  0.947331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1328  secretion protein HlyD family protein  50.88 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  47.84 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  50.18 
 
 		 291 aa  248  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  48.69 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  48.69 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2628  HlyD family secretion protein  51.23 
 
 		 291 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  48.23 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  48.23 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.81 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  45.16 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1851  FusE  49.82 
 
 		 291 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1675  putative fusaric acid resistance protein  49.47 
 
 		 293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1697  putative fusaric acid resistance protein  49.47 
 
 		 293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420489  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0964  secretion protein HlyD  50.53 
 
 		 291 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000197103  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1446  secretion protein HlyD family protein  50.53 
 
 		 291 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0932  hypothetical protein  49.47 
 
 		 293 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0746  hypothetical protein  49.47 
 
 		 293 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1465  hypothetical protein  49.47 
 
 		 293 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0416  hypothetical protein  49.47 
 
 		 293 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87523  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1424  secretion protein HlyD family protein  50.53 
 
 		 291 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  46.64 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  42.5 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  43.73 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  45.52 
 
 		 288 aa  232  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  43.37 
 
 		 285 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  45 
 
 		 291 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  43.37 
 
 		 285 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  45 
 
 		 291 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  45 
 
 		 291 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  45 
 
 		 291 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.37 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  43.37 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  43.37 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1869  secretion protein HlyD family protein  50.18 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  46.39 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  43.01 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  46.24 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  48.45 
 
 		 304 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03101  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  44.41 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03052  hypothetical protein  44.41 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0465  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  44.41 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3537  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  44.41 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.06 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  44.06 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  44.41 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  46.81 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.62 
 
 		 358 aa  222  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  48 
 
 		 300 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  47.28 
 
 		 327 aa  221  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3826  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  46.01 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  44.91 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  45.17 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0263  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  43.66 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  43.77 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4558  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  44.06 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  43.77 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4754  secretion protein HlyD family protein  45.59 
 
 		 359 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0178648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3725  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  43.77 
 
 		 310 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0948843 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3628  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  43.77 
 
 		 310 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0802422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3663  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  43.77 
 
 		 310 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  42.75 
 
 		 351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0272  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  41.49 
 
 		 321 aa  218  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  45.52 
 
 		 328 aa  218  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  46.21 
 
 		 334 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>