More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1216 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 383 aa  777    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  58.42 
 
 		 373 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  44.25 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  39.07 
 
 		 368 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  38.29 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  40.23 
 
 		 354 aa  249  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  39.17 
 
 		 381 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  38.24 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  37.78 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  37.78 
 
 		 364 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  36.71 
 
 		 377 aa  233  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  38.57 
 
 		 367 aa  233  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  36.94 
 
 		 368 aa  232  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  37.2 
 
 		 364 aa  225  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  36.2 
 
 		 365 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  38.75 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  38.66 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  38.57 
 
 		 386 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0750  secretion protein HlyD family protein  38.33 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  37.79 
 
 		 365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  34.3 
 
 		 354 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  36.9 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  33.24 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  36.28 
 
 		 365 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  32.76 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  32.06 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  34.48 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0621  secretion protein HlyD family protein  33.04 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.602249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1770  putative secretion protein  31.62 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  31.34 
 
 		 352 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  31.87 
 
 		 352 aa  157  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  30.29 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  31.9 
 
 		 354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  30.21 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  32.84 
 
 		 352 aa  154  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  29.91 
 
 		 331 aa  152  8e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0565  secretion protein HlyD family protein  30.95 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3434  secretion protein HlyD family protein  31.14 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0517  secretion protein HlyD family protein  31.14 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  30.95 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  30.95 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0570  secretion protein HlyD family protein  30.95 
 
 		 352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  32.34 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4051  HlyD family secretion protein  30.77 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  30.09 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  30.15 
 
 		 376 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  31.08 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  27.16 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  29.73 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  26 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3625  secretion protein HlyD  31.91 
 
 		 354 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.110233  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  30.46 
 
 		 376 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  28.83 
 
 		 341 aa  132  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  31.21 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  33.65 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  30.46 
 
 		 368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  29.51 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  30.67 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  29.81 
 
 		 351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  29.69 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  29.13 
 
 		 351 aa  126  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  29.45 
 
 		 378 aa  126  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  29.45 
 
 		 378 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  29.45 
 
 		 378 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  29.45 
 
 		 378 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  29.45 
 
 		 378 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  29.45 
 
 		 378 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  29.45 
 
 		 378 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  29.45 
 
 		 378 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  29.36 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  29.75 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  29.43 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2805  HlyD family secretion protein  29.48 
 
 		 381 aa  123  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.743395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  29.14 
 
 		 378 aa  122  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  29.17 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  28.81 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  29.45 
 
 		 334 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  30.07 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  28.83 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  31.49 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  32.14 
 
 		 383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  31.49 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  28.22 
 
 		 366 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  28.53 
 
 		 378 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  29.83 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  27.95 
 
 		 413 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  28.62 
 
 		 366 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  31.16 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  28.09 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  27.73 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  30 
 
 		 400 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  30 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  30.45 
 
 		 467 aa  117  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2656  secretion protein HlyD  29.96 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  29.87 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  29.87 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  27.99 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  29.06 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  29.87 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>