More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0234 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 321 aa  639    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4352  multidrug resistance protein MdtN  33.83 
 
 		 349 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4510  multidrug resistance protein MdtN  33.74 
 
 		 349 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803564  normal  0.0531786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  31.21 
 
 		 343 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  31.21 
 
 		 351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  31.21 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  30.87 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  30.87 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  30.87 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  30.87 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4577  multidrug resistance protein MdtN  33.54 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603811  hitchhiker  0.0000103156 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  30.87 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  30.87 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4112  multidrug resistance protein MdtN  33.54 
 
 		 349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  33.44 
 
 		 349 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  32.62 
 
 		 349 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3647  multidrug resistance protein MdtN  32.62 
 
 		 349 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00582079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  32.62 
 
 		 349 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  32.62 
 
 		 349 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  30.52 
 
 		 349 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  30.52 
 
 		 349 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  30.19 
 
 		 349 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  31.17 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  29.19 
 
 		 285 aa  119  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2193  multidrug resistance protein MdtN  31.66 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  28.09 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  30.31 
 
 		 372 aa  119  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  28.88 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  29.79 
 
 		 374 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.57 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  28.57 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  30.09 
 
 		 285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  28.57 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  26.75 
 
 		 331 aa  115  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.26 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  26.75 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  28.42 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  24.92 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2119  multidrug resistance protein MdtN  30.33 
 
 		 349 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  27.55 
 
 		 354 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  28.44 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  28.1 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  28.62 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  26.93 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  25.39 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  30.16 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  25.84 
 
 		 355 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  32.93 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  27.16 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  28.05 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  29.63 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  27.74 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  28.75 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  30.72 
 
 		 356 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0195  multidrug resistance protein MdtN  27.11 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0296812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  24.62 
 
 		 364 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  27.85 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  27.49 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0621  secretion protein HlyD family protein  30.49 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.602249  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  29.43 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  28.57 
 
 		 368 aa  102  7e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  28.38 
 
 		 404 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  28.15 
 
 		 406 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  28.31 
 
 		 352 aa  102  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  29.53 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  26.52 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  30.67 
 
 		 367 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  25.45 
 
 		 378 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  24.71 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  30.36 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  29.25 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  29.25 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  27.98 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  29.81 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  29.25 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  28.44 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  29.25 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  28.86 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  28.52 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  27.08 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  28.22 
 
 		 304 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 324 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  26.79 
 
 		 411 aa  99.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.91 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  27.39 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  27.39 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  26.91 
 
 		 352 aa  99.8  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  29.06 
 
 		 289 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  31.25 
 
 		 363 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  29.06 
 
 		 289 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  28.66 
 
 		 352 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  28.66 
 
 		 352 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  26.52 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  29.17 
 
 		 364 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  28.21 
 
 		 334 aa  99  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  29.55 
 
 		 364 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  29.55 
 
 		 364 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>