More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000534 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  100 
 
 		 352 aa  716    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  64.77 
 
 		 352 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  62.78 
 
 		 352 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0565  secretion protein HlyD family protein  62.78 
 
 		 352 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  62.78 
 
 		 352 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0570  secretion protein HlyD family protein  62.78 
 
 		 352 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0621  secretion protein HlyD family protein  63.35 
 
 		 352 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.602249  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3434  secretion protein HlyD family protein  61.93 
 
 		 352 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0517  secretion protein HlyD family protein  62.22 
 
 		 352 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  59.38 
 
 		 356 aa  421  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  62.22 
 
 		 352 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4051  HlyD family secretion protein  61.34 
 
 		 357 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  55.97 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  52.56 
 
 		 352 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1770  putative secretion protein  52.56 
 
 		 352 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  45.8 
 
 		 344 aa  318  7e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  44.35 
 
 		 354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3625  secretion protein HlyD  44.07 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.110233  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  38.14 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  37.04 
 
 		 355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  39.09 
 
 		 355 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  33.24 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  33.52 
 
 		 378 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  31.9 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  33.52 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  31.87 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  32.93 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  30.86 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  31.11 
 
 		 365 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  33.04 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  30.81 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  33.33 
 
 		 354 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  30.61 
 
 		 364 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  35 
 
 		 386 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  30.14 
 
 		 364 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  30.95 
 
 		 364 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  31.07 
 
 		 365 aa  155  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0750  secretion protein HlyD family protein  33.05 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 365 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  31.86 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  32.82 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  33.92 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  34.97 
 
 		 367 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  32.49 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06917  hypothetical protein  25.87 
 
 		 356 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0470  secretion protein HlyD family protein  24.93 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  31.77 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  33.77 
 
 		 334 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  33.88 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  31.44 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  30.99 
 
 		 343 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  30.99 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  30.99 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  30.99 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  30.67 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  30.67 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  30.67 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  30.35 
 
 		 343 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  30.72 
 
 		 341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  31.23 
 
 		 351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  29.76 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  31.56 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  28.09 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  29.04 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  27.56 
 
 		 376 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  29.97 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  29.37 
 
 		 375 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  29.37 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  27.83 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  29.75 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  29.47 
 
 		 402 aa  106  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  27.83 
 
 		 444 aa  106  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  28.86 
 
 		 354 aa  106  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  25.23 
 
 		 376 aa  105  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  30.74 
 
 		 346 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  31.83 
 
 		 392 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  25.57 
 
 		 376 aa  102  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  31.15 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2119  multidrug resistance protein MdtN  31.1 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  29.43 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  29.06 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  33.19 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  26.54 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0473  hypothetical protein  26.65 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  30.51 
 
 		 286 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  25.14 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  25.14 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  25.14 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  26.54 
 
 		 381 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  25.14 
 
 		 381 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  28.08 
 
 		 378 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  28.16 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  30.25 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  26.82 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  28.87 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  27.22 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  27.22 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0497  hypothetical protein  26.65 
 
 		 345 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  27.22 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>