More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0138 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  88.62 
 
 
378 aa  706    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  88.62 
 
 
378 aa  706    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  88.62 
 
 
378 aa  706    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
378 aa  771    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  91.8 
 
 
378 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  88.62 
 
 
378 aa  706    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  88.36 
 
 
378 aa  704    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  88.62 
 
 
378 aa  706    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  88.62 
 
 
378 aa  706    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  88.1 
 
 
378 aa  699    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0115  secretion protein HlyD family protein  83.07 
 
 
378 aa  662    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  88.62 
 
 
378 aa  706    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  77.78 
 
 
378 aa  617  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  77.78 
 
 
378 aa  617  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  77.51 
 
 
378 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  77.78 
 
 
378 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  77.78 
 
 
378 aa  617  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  77.51 
 
 
378 aa  615  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  77.51 
 
 
378 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  77.78 
 
 
378 aa  615  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3693  secretion protein HlyD family protein  60.85 
 
 
378 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  47.49 
 
 
381 aa  359  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  47.23 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  45.91 
 
 
381 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  45.91 
 
 
381 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  45.91 
 
 
381 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  47.09 
 
 
376 aa  355  6.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  47.48 
 
 
378 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  45.65 
 
 
381 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  46.95 
 
 
378 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  48.35 
 
 
378 aa  351  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0890  secretion protein HlyD family protein  46.03 
 
 
378 aa  349  4e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3193  secretion protein HlyD family protein  46.7 
 
 
381 aa  349  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.252667 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  45.77 
 
 
376 aa  345  8e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0873  secretion protein HlyD family protein  46.42 
 
 
378 aa  342  4e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  47.55 
 
 
385 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  46.03 
 
 
376 aa  333  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  46.56 
 
 
376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2805  HlyD family secretion protein  44.56 
 
 
381 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.743395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3029  hypothetical protein  39.06 
 
 
382 aa  275  8e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3252  secretion protein HlyD family protein  38.06 
 
 
319 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2518  secretion protein HlyD  30.83 
 
 
379 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.554546  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4620  putative membrane fusion protein of efflux pump HlyD family v  28.93 
 
 
392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  28.91 
 
 
313 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  31.4 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  28.83 
 
 
383 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  28.24 
 
 
354 aa  116  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 
355 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  28.22 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  31.97 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2977  secretion protein HlyD  29.21 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  34.12 
 
 
367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  27.64 
 
 
355 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1210  secretion protein HlyD family protein  30.71 
 
 
311 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  28.07 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  30.83 
 
 
368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  28.24 
 
 
354 aa  109  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  31.78 
 
 
368 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  26.65 
 
 
365 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  29.28 
 
 
352 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  27.14 
 
 
381 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  27.4 
 
 
378 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  27.84 
 
 
349 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05325  hypothetical protein  25.37 
 
 
400 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  27.42 
 
 
365 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000563  multidrug resistance efflux pump  24.94 
 
 
407 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0293692  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  29.59 
 
 
354 aa  102  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  26.48 
 
 
364 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  28.57 
 
 
374 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  26.76 
 
 
356 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  26.45 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  28.39 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  25 
 
 
344 aa  97.4  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  26.41 
 
 
364 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  31.82 
 
 
354 aa  97.4  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  31 
 
 
351 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  29.1 
 
 
372 aa  96.3  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  28.39 
 
 
366 aa  96.3  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  26.27 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  28.14 
 
 
361 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  30.13 
 
 
368 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  28.85 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  26.95 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  29.43 
 
 
460 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  29.33 
 
 
460 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  27.93 
 
 
365 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0750  secretion protein HlyD family protein  27.93 
 
 
365 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  27.93 
 
 
365 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  29.08 
 
 
356 aa  90.1  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  25.63 
 
 
352 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3625  secretion protein HlyD  32.93 
 
 
354 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.110233  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  27.3 
 
 
352 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  27.47 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  27.49 
 
 
343 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  27.49 
 
 
343 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1965  putative membrane fusion protein family member  26.2 
 
 
396 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  27.49 
 
 
343 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  28.01 
 
 
470 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  27.49 
 
 
343 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  28.01 
 
 
475 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>