More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3421 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 355 aa  721    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  59.77 
 
 		 354 aa  451  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  54.93 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  39.94 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0565  secretion protein HlyD family protein  41.08 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  41.08 
 
 		 352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  41.08 
 
 		 352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0570  secretion protein HlyD family protein  41.08 
 
 		 352 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0621  secretion protein HlyD family protein  41.36 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.602249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  39.38 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  39.09 
 
 		 352 aa  235  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3434  secretion protein HlyD family protein  40.51 
 
 		 352 aa  232  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0517  secretion protein HlyD family protein  40.51 
 
 		 352 aa  232  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  40.96 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4051  HlyD family secretion protein  40.39 
 
 		 357 aa  228  9e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  40.51 
 
 		 352 aa  228  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  38.15 
 
 		 344 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  35.39 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  32.76 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1770  putative secretion protein  36.44 
 
 		 352 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  35.98 
 
 		 352 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  35.11 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  34.75 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  33.23 
 
 		 349 aa  192  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  33.33 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  36.89 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  32.48 
 
 		 377 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  32.33 
 
 		 373 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  32.45 
 
 		 381 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  32.08 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  31.79 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  35.07 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  35.96 
 
 		 354 aa  176  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  32.76 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 365 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  32.68 
 
 		 361 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0750  secretion protein HlyD family protein  32.96 
 
 		 365 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  31.25 
 
 		 364 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3625  secretion protein HlyD  33.99 
 
 		 354 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.110233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  31.27 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  32.11 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  30.47 
 
 		 365 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06917  hypothetical protein  29.6 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  29.61 
 
 		 331 aa  139  8.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  29.31 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0470  secretion protein HlyD family protein  25.65 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  29.64 
 
 		 374 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  28.82 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  28.82 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  29.11 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  28.82 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  28.82 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.41 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  28.82 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  29.11 
 
 		 378 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  31.17 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  31.17 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  29.07 
 
 		 376 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  28.11 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  29.06 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  31.35 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  28.74 
 
 		 376 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  29.76 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  27.3 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  27.13 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  31.51 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  31.78 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  31.78 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  31.78 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  31.78 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  28.37 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  31.78 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  31.03 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  25.84 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  31.29 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  31.46 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  33.69 
 
 		 380 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  31.46 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  27.5 
 
 		 366 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  27.84 
 
 		 354 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  29.43 
 
 		 355 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  26.79 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  27.3 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  27.41 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  27.3 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  29.12 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  29.12 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  29.12 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  29.12 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  29.12 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  27.5 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  29.12 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  29.12 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  29.12 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  29.12 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>