More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2138 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  100 
 
 		 365 aa  729    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  70.67 
 
 		 378 aa  524  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  73.98 
 
 		 381 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  68.54 
 
 		 377 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  71.23 
 
 		 386 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  67.51 
 
 		 365 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0750  secretion protein HlyD family protein  66.67 
 
 		 365 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  65.83 
 
 		 365 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  64.31 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  50.41 
 
 		 364 aa  364  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  50.41 
 
 		 364 aa  363  4e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  51.33 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  38.16 
 
 		 373 aa  245  6.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  35.69 
 
 		 383 aa  232  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  36.5 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  34.42 
 
 		 373 aa  202  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  32.12 
 
 		 355 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  35.99 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  35.1 
 
 		 354 aa  186  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  34.17 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  37.57 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  33.24 
 
 		 354 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  34.81 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  32.2 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  32 
 
 		 349 aa  166  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  31.94 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  29.89 
 
 		 354 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  30.28 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4051  HlyD family secretion protein  31.53 
 
 		 357 aa  160  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0565  secretion protein HlyD family protein  31.25 
 
 		 352 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  31.25 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  31.25 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0570  secretion protein HlyD family protein  31.25 
 
 		 352 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3625  secretion protein HlyD  34.9 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.110233  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0621  secretion protein HlyD family protein  30.97 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.602249  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3434  secretion protein HlyD family protein  30.68 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0517  secretion protein HlyD family protein  30.68 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  32.51 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  35 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1770  putative secretion protein  35.28 
 
 		 352 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  32.32 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  29.72 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  30.68 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  28.77 
 
 		 344 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  33.23 
 
 		 351 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  30.67 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  30.16 
 
 		 331 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  34.58 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  34.58 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  34.58 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  34.58 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  34.58 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  34.58 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  34.58 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  34.58 
 
 		 343 aa  133  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  29.36 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0195  multidrug resistance protein MdtN  34.92 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0296812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  31.83 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2656  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 326 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  31.52 
 
 		 351 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  31 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  30.7 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  30.29 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  30.18 
 
 		 355 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  31.29 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  30.53 
 
 		 349 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  32.53 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  30.74 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  29.82 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  32.08 
 
 		 349 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  29.52 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4577  multidrug resistance protein MdtN  30.22 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603811  hitchhiker  0.0000103156 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  32.08 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  32.08 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  34.27 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  31.79 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3647  multidrug resistance protein MdtN  31.79 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00582079  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  30.6 
 
 		 383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  31.79 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4112  multidrug resistance protein MdtN  29.91 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3904  efflux pump membrane protein  31.85 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  30.82 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  31.58 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  28.34 
 
 		 368 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  28.29 
 
 		 381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  28.29 
 
 		 381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  28.29 
 
 		 381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  28.29 
 
 		 381 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  32.31 
 
 		 363 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  30.57 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.33 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  28.33 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  28.33 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  28.53 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  28.33 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  28.33 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  28.33 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0890  secretion protein HlyD family protein  29.75 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  28.37 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  27.14 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>