More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2293 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  100 
 
 		 365 aa  724    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  40.18 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  36.62 
 
 		 373 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  41.41 
 
 		 354 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  39.76 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  33.88 
 
 		 383 aa  215  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  37.67 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  36.36 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  36.93 
 
 		 377 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  41.21 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  35.71 
 
 		 381 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  31.97 
 
 		 364 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  31.97 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  39.18 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  33.72 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  32.84 
 
 		 364 aa  186  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  34.81 
 
 		 365 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  35.98 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0750  secretion protein HlyD family protein  35.69 
 
 		 365 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  35.01 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  34.32 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  32.88 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  30.14 
 
 		 354 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  30.14 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  31.69 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  30.06 
 
 		 355 aa  152  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  30.46 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  31.02 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  32.29 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  26.88 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0621  secretion protein HlyD family protein  32.61 
 
 		 352 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.602249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  29.05 
 
 		 356 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  26.56 
 
 		 331 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  32.3 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0565  secretion protein HlyD family protein  30.43 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1770  putative secretion protein  33.11 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  32.78 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  29.87 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  36.26 
 
 		 334 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  30.17 
 
 		 352 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  30.17 
 
 		 352 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3434  secretion protein HlyD family protein  31.99 
 
 		 352 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0517  secretion protein HlyD family protein  31.99 
 
 		 352 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  36.26 
 
 		 334 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0570  secretion protein HlyD family protein  30.17 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  29.83 
 
 		 374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  28.62 
 
 		 344 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  31.38 
 
 		 420 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4051  HlyD family secretion protein  31.01 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  34.12 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0470  secretion protein HlyD family protein  24.56 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  28.9 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  32.2 
 
 		 352 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3625  secretion protein HlyD  33.13 
 
 		 354 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.110233  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  33.98 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  29.18 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  30.72 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  30.71 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  31.4 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  32.57 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  31 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  32.24 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  30.19 
 
 		 411 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  31.53 
 
 		 360 aa  126  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  31.1 
 
 		 413 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  30.19 
 
 		 411 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  30.19 
 
 		 411 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  30.19 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  30.19 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  30.19 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  30.19 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  32.24 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  32.24 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  31.98 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  32.24 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  32.24 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  30.41 
 
 		 424 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  31.46 
 
 		 463 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  26.01 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  31.91 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  30.06 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  29.45 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2193  multidrug resistance protein MdtN  30.77 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  31.58 
 
 		 343 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  29.3 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  29.3 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  29.3 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  32.12 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  28.49 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  26.98 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  30.18 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  28.53 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  29.11 
 
 		 407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  30.79 
 
 		 349 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  31.54 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  29.11 
 
 		 405 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  28.73 
 
 		 404 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  28.99 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>