More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003056 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  100 
 
 		 354 aa  725    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  59.77 
 
 		 355 aa  435  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  50.85 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  39.31 
 
 		 344 aa  236  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  38.14 
 
 		 352 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 		 356 aa  222  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 		 352 aa  222  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3434  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0517  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 		 352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0621  secretion protein HlyD family protein  37.85 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.602249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  36.16 
 
 		 352 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  36.13 
 
 		 354 aa  215  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0565  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0570  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 352 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  34.3 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4051  HlyD family secretion protein  36.49 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  31.9 
 
 		 349 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1770  putative secretion protein  35.49 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3625  secretion protein HlyD  35.57 
 
 		 354 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.110233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  35.49 
 
 		 352 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  31.4 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  34.31 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  32.86 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  35.78 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  31.58 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  33.94 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  31.73 
 
 		 349 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  31.49 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  34.27 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  29.81 
 
 		 364 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  29.53 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  30.21 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  32.14 
 
 		 381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0750  secretion protein HlyD family protein  31.81 
 
 		 365 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  32.2 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  31.23 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  31.56 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  29.67 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  29.5 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  30.95 
 
 		 365 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  30.65 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  31.58 
 
 		 354 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06917  hypothetical protein  27.22 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0470  secretion protein HlyD family protein  25.54 
 
 		 379 aa  125  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  28.06 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  27.76 
 
 		 331 aa  122  8e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  29.91 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  28.24 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  28.24 
 
 		 378 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  31.13 
 
 		 344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  27.95 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  27.95 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  29.93 
 
 		 296 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  27.7 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  27.7 
 
 		 378 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  27.7 
 
 		 378 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  27.7 
 
 		 378 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  28.11 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  27.41 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  27.68 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  27.7 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  29.97 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  29.22 
 
 		 374 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  29.22 
 
 		 368 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  26.8 
 
 		 378 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  26.8 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  26.8 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  26.8 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  26.88 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  26.8 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  26.8 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  26.8 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.8 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  28.29 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  28.84 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  29.56 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0115  secretion protein HlyD family protein  25.73 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  26.51 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  29.34 
 
 		 343 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  28.53 
 
 		 343 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  30.28 
 
 		 343 aa  106  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  28.53 
 
 		 343 aa  106  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  28.53 
 
 		 343 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  29.96 
 
 		 365 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  31.1 
 
 		 392 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  29.34 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  26.53 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  27.98 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0234  secretion protein HlyD family protein  27.74 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  28.2 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  28.2 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 		 378 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  28.43 
 
 		 285 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  27.48 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  27.99 
 
 		 413 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  27.79 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  28.81 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>