More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4014 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  88.1 
 
 		 378 aa  699    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  99.21 
 
 		 378 aa  761    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  99.21 
 
 		 378 aa  761    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  99.21 
 
 		 378 aa  761    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  99.21 
 
 		 378 aa  761    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  99.21 
 
 		 378 aa  761    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0115  secretion protein HlyD family protein  80.42 
 
 		 378 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  98.94 
 
 		 378 aa  759    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  99.21 
 
 		 378 aa  761    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  89.68 
 
 		 378 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  100 
 
 		 378 aa  771    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  99.21 
 
 		 378 aa  761    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  76.46 
 
 		 378 aa  610  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  76.72 
 
 		 378 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  76.72 
 
 		 378 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  76.46 
 
 		 378 aa  610  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  76.72 
 
 		 378 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  76.46 
 
 		 378 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  76.19 
 
 		 378 aa  609  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  76.46 
 
 		 378 aa  609  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3693  secretion protein HlyD family protein  59.52 
 
 		 378 aa  460  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  45.65 
 
 		 381 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  45.38 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  46.58 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  44.83 
 
 		 378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  44.83 
 
 		 378 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  43.27 
 
 		 381 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  43.27 
 
 		 381 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  43.27 
 
 		 381 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  43.01 
 
 		 381 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3193  secretion protein HlyD family protein  44.59 
 
 		 381 aa  333  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.252667 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0890  secretion protein HlyD family protein  43.65 
 
 		 378 aa  333  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  45.38 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  45.53 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0873  secretion protein HlyD family protein  42.97 
 
 		 378 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  44.18 
 
 		 376 aa  315  6e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2805  HlyD family secretion protein  44.03 
 
 		 381 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.743395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  43.41 
 
 		 385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  43.95 
 
 		 376 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3029  hypothetical protein  37.73 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3252  secretion protein HlyD family protein  37.27 
 
 		 319 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4620  putative membrane fusion protein of efflux pump HlyD family v  29.18 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2518  secretion protein HlyD  28.83 
 
 		 379 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.554546  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  29.14 
 
 		 383 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  31.4 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  27.35 
 
 		 313 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  28.65 
 
 		 373 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2977  secretion protein HlyD  28.25 
 
 		 313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  30.63 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  26.72 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  31.06 
 
 		 354 aa  110  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  28.32 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  28.22 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  28.16 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  27.25 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  26.51 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  32.44 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1210  secretion protein HlyD family protein  27.66 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  27.54 
 
 		 354 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  28.7 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  31.06 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  27.15 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  28.99 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  27.04 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  27.56 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  26.39 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  27.71 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  26.39 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 		 386 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  27.33 
 
 		 344 aa  92.8  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  29.89 
 
 		 460 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  30.82 
 
 		 470 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  29.91 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  29.89 
 
 		 460 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  26.47 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  30.82 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  30.82 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  28.09 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1965  putative membrane fusion protein family member  27.2 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  29.08 
 
 		 356 aa  90.5  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0750  secretion protein HlyD family protein  28.09 
 
 		 365 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  30.42 
 
 		 354 aa  89.7  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  28.09 
 
 		 365 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  25.85 
 
 		 368 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  25.07 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  27.92 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0618  secretion protein HlyD family protein  26.95 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  28.27 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  27.72 
 
 		 352 aa  87.4  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  29.3 
 
 		 402 aa  86.7  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  27.12 
 
 		 366 aa  86.3  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  27.12 
 
 		 366 aa  86.7  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  28.52 
 
 		 468 aa  86.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05325  hypothetical protein  24.07 
 
 		 400 aa  86.3  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1770  putative secretion protein  29.02 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  29.41 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0470  secretion protein HlyD family protein  24.44 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  29.96 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  24.57 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>